赤拟谷盗TRE基因家族特性及RNAi抑制表达效果分析 |
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引用本文: | 唐斌,肖仲久,曾伯平,邱玲玉,潘碧莹,李昆,张道伟.赤拟谷盗TRE基因家族特性及RNAi抑制表达效果分析[J].环境昆虫学报,2019,41(6). |
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作者姓名: | 唐斌 肖仲久 曾伯平 邱玲玉 潘碧莹 李昆 张道伟 |
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作者单位: | 遵义师范学院生物与农业科技学院, 贵州遵义563006;杭州师范大学生命与环境科学学院, 杭州310036;遵义师范学院生物与农业科技学院,贵州遵义,563006;杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州,310036 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;贵州省科技计划 |
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摘 要: | 分析赤拟谷盗海藻糖酶基因(Trehalase,简称TRE)家族的特性及RNAi介导的TRE基因沉默后的相互作用效果。采用生物信息学和相关软件分析5个海藻糖酶基因序列特征以及二级结构等分子特性并推测其生理功能,用MEGA 6.0软件构建TRE与其它昆虫TRE的系统进化树;采用注射RNAi技术,分别干扰赤拟谷盗海藻糖酶基因mRNA的表达;采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术检测单个海藻糖酶基因表达抑制后对其它TRE基因mRNA表达的影响。赤拟谷盗4个可溶性海藻糖酶TRE1蛋白相似性高,具有类似的二级结构,即含有相似比例的α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲,膜结合型海藻糖酶TRE2与TRE1在蛋白质的二级结构上差异较大;系统进化树分析表明赤拟谷盗的可溶性海藻糖酶与其它昆虫的TRE1聚集在一起,膜结合型海藻糖酶与其它昆虫的TRE2聚集在一起;RNAi实验结果表明单独干扰某个TRE1基因的mRNA表达后,其它3个TRE1基因的表达有的上升,有的下降,而TRE2基因表达都为显著下降;单独干扰TRE2基因表达,则其它4个TRE1基因的表达一致显著下降。赤拟谷盗可溶性TRE1和膜结合型TRE2的二级结构差异较大,单个TRE基因表达被抑制后,其他TRE基因存在连锁抑制或者互补功能。
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关 键 词: | 赤拟谷盗 海藻糖酶 基因特性 RNAi 实时荧光定量PCR |
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