| 狭果葶苈高温响应表达序列标签的分离与初步分析 |
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| 引用本文： | 刘德团,李婉莎,杨永平,胡向阳.狭果葶苈高温响应表达序列标签的分离与初步分析[J].生物技术通讯,2011,22(5):617-622. |
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| 作者姓名： | 刘德团 李婉莎 杨永平 胡向阳 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院昆明植物研究所,云南昆明650204;中国科学院研究生院,北京100049
2. 中国科学院昆明植物研究所,云南昆明,650204 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目，中国科学院百人计划项目 |
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| 摘 要： | 目的:分离与分析白马雪山流石滩地区植物狭果葶苈高温响应基因,研究高山植物高温耐受机制。方法:应用磁珠介导的抑制消减杂交分离差异表达序列标签(EST),通过测序与Blastx比对,用Blast2go程序进行功能注释和代谢路径分析。结果:大部分EST功能与物质能量代谢、生物合成、蛋白和脂肪结合、转移酶活性相关,还有一些胁迫响应的基因。结论:狭果葶苈高温胁迫应答机制是非常复杂的,需要众多基因的参与。
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| 关 键 词： | 狭果葶苈 高温响应 抑制消减杂交 表达序列标签 注释 Blast2go程序 |
Isolation and Primary Analysis of High Temperature Responsive EST from Draba stenocarpa |
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| LIU De-Tuan,LI Wan-Sha,YANG Yong-Ping,HU Xiang-Yang.Isolation and Primary Analysis of High Temperature Responsive EST from Draba stenocarpa[J].Letters in Biotechnology,2011,22(5):617-622. |
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| Authors: | LIU De-Tuan LI Wan-Sha YANG Yong-Ping HU Xiang-Yang |
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| Institution: | LIU De-Tuan a,b,LI Wan-Sha a,YANG Yong-Ping a,HU Xiang-Yang a a.Kunming Institute of Botany,Kunming 650204,b.Graduate University,Beijing 100049,Chinese Academy of Sciences,China |
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| Abstract: | Objective: To isolate the high-temperature responsive differential expressed sequence tag(EST) from Draba stenocarpa,study the mechanism of alpine plants responsive to high temperature.Methods: Suppression sub-tractive hybridization(SSH) based on magnetic beads technology was used to isolate the EST.After sequencing,Blastx,functional annotation and metabolism analysis were conducted with Blast2go.Results: Most EST related to material and energy metabolism,biosynthetic process,lipid binding,protein binding a... |
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| Keywords: | Draba stenocarpa high-temperature response suppression subtractive hybridization expressed se-quence tag annotation Blast2go |
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