| 基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义 |
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| 引用本文： | 王唯斯,梅雯,孙美涛,李彬,张态,张若鹏,熊伟.基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义[J].生物技术通讯,2019(2):163-169. |
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| 作者姓名： | 王唯斯 梅雯 孙美涛 李彬 张态 张若鹏 熊伟 |
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| 作者单位： | 大理大学基础医学院;大理大学公共卫生学院;大理大学第一附属医院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81560458;31601155);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2017HB077);云南省教育厅科学研究基金指导性项目(2016ZDX01;2016ZDX05);大理大学博士科研启动基金(BSKY2012018);大理大学大学生创新创业计划(S-CXCY-2017-8) |
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| 摘 要： | 目的:探究人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine数据库中的MTERF2信息,对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析;从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载胰腺癌数据集MTERF2 RNA Seq V2数据及临床病理资料;利用R 2.15.3软件分析MTERF2表达量与临床病理参数的相关性及预后;利用Kaplan-Meier生存函数分析MTERF2表达量和胰腺癌患者预后的关联。结果:Oncomine数据库中共收集了586个不同类型的研究结果,其中关于MTERF2表达有统计学差异的研究有58个,MTERF2表达增高的研究有26个,表达减低的研究有32个。共有9项研究涉及MTERF2在胰腺癌组织和正常组织中的表达,包括226例临床样本,与对照组相比,MTERF2在胰腺癌中低表达(P=7.34×10-6)。TCGA胰腺癌数据集中共收集179例具有临床病理参数的病例及其对应的MTERF2 mRNA表达量。剔除病理参数不详或不完整的病例,利用R 2.15.3软件分析发现,MTERF2 mRNA表达量与胰腺癌患者T分期、M分期、癌症类型及原发部位存在显著相关(均P<0.05),而与患者的年龄、性别、N分期、AJCC病理分期、等级、组织学类型及饮酒史无显著相关(均P>0.05)。Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺癌患者MTERF2的表达水平与总生存率(OS)无显著相关性(P>0.05),而与无病生存率(DFS)显著相关(P<0.001)。结论:Oncomine和TCGA数据挖掘显示,人MTERF2在胰腺癌组织中低表达,且MTERF2表达量与胰腺癌患者总生存率无显著相关性,与无病生存率有显著相关性。
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| 关 键 词： | 线粒体转录终止因子2(MTERF2) 胰腺癌 Oncomine数据库 癌症基因组图谱(TCGA) 数据挖掘 |
Data-Mining from Oncomine Database and TCGA for MTERF2 Expression in Human Pancreatic Cancer |
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| WANG Wei-Si,MEI Wen,SUN Mei-Tao,LI Bin,ZHANG Tai,ZHANG Ruo-Peng,XIONG Wei.Data-Mining from Oncomine Database and TCGA for MTERF2 Expression in Human Pancreatic Cancer[J].Letters in Biotechnology,2019(2):163-169. |
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| Authors: | WANG Wei-Si MEI Wen SUN Mei-Tao LI Bin ZHANG Tai ZHANG Ruo-Peng XIONG Wei |
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| Institution: | (College of Basic Medical Sciences,Dali University,Dali 671000,China;College of Public Health,Dali University,Dali 671000,China;First Affiliated Hospital,Dali University,Dali 671000,China) |
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| Abstract: | WANG Wei-Si;MEI Wen;SUN Mei-Tao;LI Bin;ZHANG Tai;ZHANG Ruo-Peng;XIONG Wei(College of Basic Medical Sciences,Dali University,Dali 671000,China;College of Public Health,Dali University,Dali 671000,China;First Affiliated Hospital,Dali University,Dali 671000,China) |
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| Keywords: | |
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