犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析 |
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引用本文: | 孙文超,曹慧慧,郑敏,徐素萍,张红云,韦显凯,苏姣秀,何杰勇.犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析[J].病毒学报,2016,32(4). |
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作者姓名: | 孙文超 曹慧慧 郑敏 徐素萍 张红云 韦显凯 苏姣秀 何杰勇 |
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作者单位: | 广西大学动物科技学院,南宁,530001;广西动物疫病预防控制中心,南宁,530001;玉林市动物疫病预防控制中心,玉林,537000;江州区动物疫病预防控制中心,崇左,532200 |
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基金项目: | 广西壮族自治区科学基金 |
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摘 要: | 犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒。为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014。序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸)。同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1%-89.5%,而Rep和Cap基因同源性分别为82.1%-89.5%和84.6%-89.1%。遗传进化树分析显示,目前世界流行的DogCV存在多个分支,而JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株处于不同分支。
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关 键 词: | 犬圆环病毒 基因 进化分析 |
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