| 2018-2019年福州腹泻住院儿童A组轮状病毒全基因组分析 |
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| 引用本文： | 黄枝妙,吴冰珊,林琦,林卫东,翁育伟.2018-2019年福州腹泻住院儿童A组轮状病毒全基因组分析[J].病毒学报,2021,37(6):1385-1393. |
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| 作者姓名： | 黄枝妙 吴冰珊 林琦 林卫东 翁育伟 |
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| 作者单位： | 福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室,福州350001;福州市儿童医院,福州350004 |
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| 摘 要： | 了解2018-2019年福州市五岁以下腹泻住院儿童标本中A组轮状病毒(RVA)基因组特征.通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对49份RVA阳性标本进行核酸扩增,对扩增到的40份标本进行全基因组二代测序,获得G1P8]型RVA毒株7株,G9P8]型RVA毒株33株.根据VP7节段分型,40株RVA毒株中有30株G9-Ⅵ亚型、3株G9-Ⅲ亚型和7株G1-Ⅰ亚型;根据VP4节段分型,40株RVA毒株均属于P8]-3亚型.全基因组核苷酸序列分析表明,除了VP7节段外,序列差异比较大的有NSP4和NSP1两个节段.本研究获得11株G9P8]型Waa-ike株(G9-P8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1),22株NSP4节段重配的G9P8]-E2株(G9-P8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E2-H1),在测序的33株G9P8]型RVA毒株中G9P8]-E2重配株占66.7％.7株G1P8]型RVA毒株均为Wa-like株.研究结果表明,2018-2019年福州地区流行的RVA毒株中G9P8]-E2重配株已经成为优势株,为了更全面了解福州地区RVA毒株的遗传变异情况,后续还需加大标本量持续进行监测.
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| 关 键 词： | A组轮状病毒 基因重配 二代测序 G/P分型 |
Whole-genome Analysis of Group a Rotavirus Circulating Among Children with Acute Diarrhea in Fuzhou,China,in 2018-2019 |
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| HUANG Zhimiao,WU Bingshan,LIN Qi,LIN Weidong,WENG Yuwei.Whole-genome Analysis of Group a Rotavirus Circulating Among Children with Acute Diarrhea in Fuzhou,China,in 2018-2019[J].Chinese Journal of Virology,2021,37(6):1385-1393. |
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| Authors: | HUANG Zhimiao WU Bingshan LIN Qi LIN Weidong WENG Yuwei |
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