山东省脑膜炎和脑炎病例中埃可病毒6型的基因特征分析 |
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引用本文: | 林小娟,陶泽新,刘桂芳,王敏,宋立志,王素婷,纪峰,王海岩,徐爱强.山东省脑膜炎和脑炎病例中埃可病毒6型的基因特征分析[J].病毒学报,2014(2):143-147. |
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作者姓名: | 林小娟 陶泽新 刘桂芳 王敏 宋立志 王素婷 纪峰 王海岩 徐爱强 |
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作者单位: | 山东省疾病预防控制中心;山东大学预防医学研究院 |
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基金项目: | 山东省医药卫生重点项目计划课题(2011QZ013);国家“十二五”科技重大专项“病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究”课题(2013ZX10004202) |
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摘 要: | 为分析山东省脑膜炎和脑炎病例中埃可病毒6型(Echovirus 6,E6)的基因特征,本研究对山东省2007~2012年间采集的脑膜炎和脑炎病例脑脊液标本进行了病毒分离,阳性分离物采用血清学和分子生物学方法鉴定型别,与国内外其他E6进行同源性分析,并构建VP1完整编码区系统进化树。本研究共分离到6株E6病毒,同源性分析显示:这6株分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为78.6%~99.8%和95.5%~100.0%,与原型株(D’Amori)核苷酸和氨基酸同源性分别为为76.9%~78.4%和92.3%~95.1%。系统进化树分析显示:山东省E6分离株可分为A、B、C和D 4个基因簇,这6株分离株属于A、B、D 3个簇。山东省E6分离株之间存在较大的遗传差异,E6在山东的循环存在不同的传播链。
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关 键 词: | 脑膜炎和脑炎病例 埃可病毒型 系统进化分析 基因 序列同源性 |
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