| 青海湖地区5株 H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列进化分析 |
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| 引用本文： | 刘琳玉,姜双应,汪立杰,易虎,赵生仓,唐志坚,徐翠玲,董婕,高荣保,张烨,邹淑梅,李晓丹,杨磊,杨静,陈涛,舒跃龙.青海湖地区5株 H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列进化分析[J].病毒学报,2014(2):109-118. |
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| 作者姓名： | 刘琳玉 姜双应 汪立杰 易虎 赵生仓 唐志坚 徐翠玲 董婕 高荣保 张烨 邹淑梅 李晓丹 杨磊 杨静 陈涛 舒跃龙 |
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| 作者单位： | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心世界卫生组织流感参比和研究合作中心;青海省疾病预防控制中心; |
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| 基金项目： | WHO 2012/2013年度加强西部省份人禽流感监测能力项目;国家重点基础研究发展973计划课题(2011CB504704);国家自然科学基金(81373107) |
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| 摘 要： | 2012年7~9月从来源于青海湖地区活禽市场的环境样本中分离到5株H9N2亚型禽流感病毒,为了了解其基因遗传进化情况,本研究通过RT-PCR技术扩增分离毒株的8个基因片段,并进行全基因序列测定。对其分子特征及全基因序列进行遗传进化分析。结果显示5株病毒的HA基因片段的核苷酸相似度为93.2%~99.1%。NA基因核苷酸的相似度为94.5%~99.8%。A/environment/qinghai/017/2012的裂解位点为PSKSSRGLF,其它4个毒株的HA裂解位点均为PSRSSRGLF。5个病毒的HA基因第226位受体结合位点均为L。M1基因片段中发生了N30D和T215A替换。遗传进化分析表明5株病毒同2005年湖南分离的A/chicken/Hunan/5260/2005(H9N2)毒株类似,为一种重配基因型禽流感病毒。其中HA、NA、NS基因片段属于Y280-like支系,MP基因片段属于G1-like支系,NP、PB1、PB2、PA四个基因片段属于F98-like支系。
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| 关 键 词： | HN 禽流感病毒 基因组 分子特征 遗传进化分析 |
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