云南省外环境中人类埃柯病毒7型分子流行病学分析

为掌握云南省外环境中肠道病毒流行和进化趋势,对从云南省外环境标本中分离到的4株病毒进行VP1基因序列测定。用肠道病毒通用引物187、188、189/011扩增病毒VP1区,直接对聚合酶链反应产物进行测序。所得序列在基因库进行广泛搜索,并与所有EV基因的相同区域进行比较。结果4株病毒为ECHO7。运用Mega软件与从GenBank中搜索到的68个ECHO7VP1区基因序列进行同源性分析,发现云南省外环境和人际间ECHO7病毒位于不同的分支。说明不同ECHO7病毒流行有地域特点和时间流行特点,同一时间同一个地区内存在不同的传播链,中国云南省同一时间内外环境和人际间ECHO7病毒有不同的传播链且进化速度不同,值得关注。利用分子生物学方法持续对云南省外环境中肠道病毒进行监测,可为肠道病毒病的预警提供有力支持。