| 采用高通量测序技术分析尾病毒目噬菌体基因组末端序列特点 |
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| 引用本文： | 李莎莎,范航,安小平,范华昊,姜焕焕,米志强,童贻刚.采用高通量测序技术分析尾病毒目噬菌体基因组末端序列特点[J].病毒学报,2013(1):39-43. |
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| 作者姓名： | 李莎莎 范航 安小平 范华昊 姜焕焕 米志强 童贻刚 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(NO.30872223);国家高技术研究发展计划(NO.2009AA02Z111);“重大新药创制”科技重大专项“十二五”实施计划(NO.2011ZX09401-023) |
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| 摘 要： | 证明噬菌体高通量测序中高频出现的序列即是噬菌体基因组的末端序列。在T3噬菌体基因组末端连接特异性序列接头,然后进行高通量测序,同时将不加接头的T3基因组也进行高通量测序,对测序结果进行生物信息学比较分析。采用类似高通量测序技术分析N4样噬菌体的全基因组序列。加接头的序列与无接头序列中的高频序列完全一致,证明了高通量测序过程中得到的高频序列就是加接头的基因组末端序列,同时证明T4样噬菌体的末端具有序列特异性而非完全随机,此外我们还发现N4样噬菌体基因组左侧末端具有唯一序列,而其基因组右侧末端不均一。高通量测序技术方便快捷,可用于噬菌体基因组末端和全基因组序列的同时测定。
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| 关 键 词： | 高通量测序 噬菌体基因组 末端序列 |
Utility of High Throughput Sequencing Technology in Analyzing the Terminal Sequence of Caudovirales Bacteriophage Genome |
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| LI Sha-sha,FAN Hang,An Xiao-ping,FAN Hua-hao,JIANG Huan-huan,MI Zhi-qiang,TONG Yi-gang.Utility of High Throughput Sequencing Technology in Analyzing the Terminal Sequence of Caudovirales Bacteriophage Genome[J].Chinese Journal of Virology,2013(1):39-43. |
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| Authors: | LI Sha-sha FAN Hang An Xiao-ping FAN Hua-hao JIANG Huan-huan MI Zhi-qiang TONG Yi-gang |
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| Institution: | (Institute of Microbiology and Epidemiology,State Key laboratory of Pathogen and Biosecurity,Beijing 100071,China) |
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