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贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析
引用本文:阎岩,吴悦,郭军,田克诚,王定明.贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析[J].病毒学报,2013(1):51-55.
作者姓名:阎岩  吴悦  郭军  田克诚  王定明
作者单位:贵州省疾病预防控制中心传染病防治研究所;贵州省人民医院儿科
基金项目:国家科技重大专项“传染病监测技术平台”项目(2009ZX10602-12)
摘    要:为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序。检测标本70份,GⅠ型诺如病毒阳性1株,阳性率1.43%,GⅡ型诺如病毒阳性34株,阳性率48.57%,获得7份GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,3株为GⅡ.4亚型,为新型变异株(GⅡ4 2011),与GⅡ4 2006b变异株的亲缘关系最近,有1个氨基酸位发生了回复突变;4株为GⅡ.3亚型,分为2个基因簇,1簇与2008~2009年韩国株(HM635118)及上海株(GU991355)的亲缘关系最近,1簇与2010年日本株(AB629943)及2007年印度株(EU921389)等的亲缘关系最近,有4个氨基酸位点易发生回复突变。

关 键 词:诺如病毒  GⅡ4型  GⅡ3型  VP1基因  贵州

Genotype Features of Norovirus Associated with Acute Gastroenteritis through Sentinel Surveillance in Guizhou Province,2011
YAN Yan,WU Yue,GUO Jun,TIAN Ke-cheng,WANG Ding-ming.Genotype Features of Norovirus Associated with Acute Gastroenteritis through Sentinel Surveillance in Guizhou Province,2011[J].Chinese Journal of Virology,2013(1):51-55.
Authors:YAN Yan  WU Yue  GUO Jun  TIAN Ke-cheng  WANG Ding-ming
Institution:1(1.Institute for Infection Disease Control and Prevention,Guizhou Center for Disease Control and Prevention,Guiyang 55000,China; 2.The People’s Hospital for Guizhou Province,Guiyang 550002,China)
Abstract:
Keywords:
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