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中国内陆发现HCoV-HKU1感染及N和S蛋白基因序列及进化分析
引用本文:段招军,黄灿平,瞿小旺,谢志萍,漆正宇,高寒春,彭夫望,刘文培,侯云德.中国内陆发现HCoV-HKU1感染及N和S蛋白基因序列及进化分析[J].病毒学报,2006,22(4):241-247.
作者姓名:段招军  黄灿平  瞿小旺  谢志萍  漆正宇  高寒春  彭夫望  刘文培  侯云德
作者单位:1. 中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,北京,100052
2. 病毒生物技术国家工程研究中心,北京,100176
摘    要:了解冠状病毒HKU1在我国大陆地区的感染情况及N基因和S基因的编码特征。采用RT-PCR的方法对2005年10月~2006年1月收集的260例急性呼吸道感染的住院儿童鼻咽抽吸物(NPA)进行了冠状病毒HKU1基因检测。将PCR阳性产物测序,并将所测序列在GenBank中进行比较分析。260份样本中共检测到2份冠状病毒HKU1阳性,阳性率为0.77%(2/260),且该2例冠状病毒HKU1阳性患者临床均表现为肺炎症状。扩增其中一株病毒N和S全基因,并进行测序,与GenBank中的冠状病毒HKU1参考株及冠状病毒科其它成员进行序列同源性和进化树分析,并对N和S蛋白的结构与功能进行了初步的预测分析。由此表明我国大陆地区存在冠状病毒HKU1感染,且可能与儿童下呼吸道感染存在相关性。

关 键 词:呼吸道感染  SARS冠状病毒  冠状病毒HKU1
文章编号:1000-8721(2006)04-0241-07
收稿时间:2006-04-18
修稿时间:2006-04-182006-05-30

Phylogenetic and Sequence Analyses of the N and S Genes of Coronavirus HKU1, a Novel Human Coronavirus in Mainland China
DUAN Zhao-jun,HUANG Can-ping,QU Xiao-wang,XIE Zhi-ping,QI Zheng-yu,GAO Han-chun,PENG Fu-wang,LIU Wen-pei,HOU Yun-de.Phylogenetic and Sequence Analyses of the N and S Genes of Coronavirus HKU1, a Novel Human Coronavirus in Mainland China[J].Chinese Journal of Virology,2006,22(4):241-247.
Authors:DUAN Zhao-jun  HUANG Can-ping  QU Xiao-wang  XIE Zhi-ping  QI Zheng-yu  GAO Han-chun  PENG Fu-wang  LIU Wen-pei  HOU Yun-de
Institution:1. National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Beijing 100052, China; 2. The National Engineering Research Center for Viral Biotechnology, Beijing 100176, China
Abstract:
Keywords:respiratory tract infection  SARS-CoV  HCoV-HKU1  
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