肝癌患者体内乙型肝炎病毒基因组BCP/Pre C区基因突变多样性分析 |
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引用本文: | 束毅,王伟,代鹏,张文涛,成珊,李达,纪奇峰,邱荣鹤,刘浩林.肝癌患者体内乙型肝炎病毒基因组BCP/Pre C区基因突变多样性分析[J].病毒学报,2017,33(1). |
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作者姓名: | 束毅 王伟 代鹏 张文涛 成珊 李达 纪奇峰 邱荣鹤 刘浩林 |
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作者单位: | 第四军医大学药学院药物基因组学教研室 西安710032;第四军医大学学员一旅五营十七连 西安710032 |
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基金项目: | 十一五重大传染病专项项目;重大新药创制"科技重大专项;陕西省科技统筹创新工程计划;国家自然科学基金 |
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摘 要: | 为研究肝癌患者组织样本中HBV DNA核心启动子区(BCP区)和前C区(Pre C区)的基因突变多样性及其突变规律。收集第四军医大学附属西京医院2015年收治的192例HBV阳性的肝癌患者组织样本,PCR扩增HBV BCP/Pre C区DNA片段并进行测序分析,从测序失败的样本中随机抽取21例,采用构建单克隆文库后测序的方法进行分析。结果显示37.89%(72/190)的HBV阳性肝癌患者体内HBV病毒因呈现多种突变株混合感染的特点而导致PCR产物直接测序失败,经单克隆测序揭示,每一例失败样本的HBV DNA准种池中至少有2~11种突变株共同存在;突变株中缺失突变和插入突变的发生率高达80.95%;其它突变形式按照频率从高到低分别为A1762T/G1764A双突变90.48%,G1756C/T1803A/Δ(1 757~1 765)/Δ(1 824~1 832)四联突变80.95%,T1753C/A1762T/G1764A三联突变57.14%,A1762T/G1764A/G1896A三联突变42.86%,G1756C/Δ(1 757~1 765)双突变28.57%,T1753C/A1762T/G1764A/G1896A四联突变23.81%。由此可见,肝癌患者体内HBV病毒具有BCP/Pre C区DNA突变的多样性,这些缺失与插入突变是导致序列移码与PCR产物测序失败的直接原因。研究结果为HBV持续感染及基因突变检测、相关机制研究和个体化防治奠定了基础。
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关 键 词: | 乙型肝炎病毒 基因突变 BCP/Pre C 肝癌 |
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