北京地区呼吸道合胞病毒分离株G蛋白基因遗传变异特性研究

为了解北京地区人呼吸道合胞病毒（human respiratory syncytial virus，HRSV）的遗传变异和分子流行病学特征，首次对北京地区2003～2004年63株HRSV分离株进行了G基因3’末端的第2个高度变异区的序列测定，并进行了基因分型和遗传变异的分析。使用不同的型特异性引物对GPA—F1和GPB-F1分别扩增A、B血清型HRSVG基因3’末端核苷酸序列，特异性扩增产物和随后的序列测定结果均显示，北京地区2003～2004年63株HRSV毒株中，96．8％（61／63）为A血清型，3．2％（2／63）为B血清型，说明北京地区在2003～2004年间存在HRSVA、B血清型共循环，但以A血清型病毒为主。分别对北京流行的A和B血清型病毒进行了基因亲缘性关系分析，结果提示，61株北京A血清型分离株全部为GA2基因型；2株B血清型分离株为GB3基因型。由此看来，GA2基因型是北京地区2003～2004年的优势流行基因型。北京61株GA2分离株之问核苷酸和氨基酸同源性分别在87．8％～100％和77．9％～100％之间；2株B血清型分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为94．7％和88．1％。这说明在2003年和2004年有很多个不同的GA2基因型HRSV毒株在北京地区共循环，北京地区的HRSV流行存在着许多由不同病毒株引起的传播链。B血清型分离株Beijing04-11于G基因3’末端含有一个60个碱基的重复序列，这是HRSV多聚酶易于重复复制限定序列的一个极端的例子，有可能是HRSV逃逸免疫压力而不断进化的一种方式。该研究首次对北京地区2003年和2004年流行的HRSV进行了基因分型和遗传变异的研究，对于了解北京HRSV流行株的基因特征具有重要意义，可以为北京乃至中国疫苗株的选择提供参考依据，从而指导HRSV的免疫预防控制。

Study on Genetic Diversity of the G Protein of Subgroups A and B Human Respiratory Syncytial Viruses Isolated in Beijing, China