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H9N2亚型禽流感病毒广东分离株的全基因克隆及序列分析
引用本文:齐岩,袁润余,张贺楠,亓文宝,单芬,胡玥,李小康,焦培荣,廖明.H9N2亚型禽流感病毒广东分离株的全基因克隆及序列分析[J].病毒学报,2010,26(3).
作者姓名:齐岩  袁润余  张贺楠  亓文宝  单芬  胡玥  李小康  焦培荣  廖明
作者单位:华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642;华南农业大学兽医学院,广州,510642;农业部动物疫病防控重点开放实验室,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广州,510642
基金项目:国家863计划项目(2006AA10A205); 国家科技支撑计划(2006BAD06A16-2); 教育部创新团队项目(IRT0723); 广东省自然科学基金创新团队项目(5200638)资助
摘    要:本研究以一株2006年广东省分离的H9N2亚型禽流感病毒A/Chicken/Guangdong/HL/2006(H9N2)(简称Ck/GD/HL/06)为研究对象,用RT-PCR法扩增病毒基因组各片段(包括5′端和3′端的非编码区序列),将扩增片段进行克隆、测序并与参考毒株的相应序列进行比较分析,绘制各基因片段的系统发生树。分析结果表明,Ck/GD/HL/06株的HA基因同1997年中国香港鸭源毒株Dk/HK/Y280/97(H9N2)在同一进化分支,从HA的糖基化位点、受体结合位点等综合分析,该毒株HA基因未发生明显的变异,符合我国大陆H9亚型禽流感病毒的特点。HA的226位氨基酸残基为亮氨酸(Leu),具有同哺乳动物SAα,2-6受体结合的特性。Ck/GD/HL/06的PB1、PA和NP基因,同2004年越南分离的人源高致病性H5N1亚型流感病毒A/VietNam/1203/2004(H5N1)株(简写A/VN/1203/04)的核苷酸序列一致性分别是93.8%、95%和96.8%,在先前的研究中未见有类似特性毒株的报道,而这种特性H9N2亚型AIV的出现,是否会增加在重组过程中产生新的高致病性H5N1亚型AIV的可能性,是值得我们关注的一个问题,也提醒在我国华南地区应更加重视防控H9N2亚型AIV,做好长期对H9N2亚型AIV监控及分子流行病学调查的工作。

关 键 词:禽流感病毒  H9N2亚型  全基因  克隆  序列分析

Cloning and Analysis of Full-length Genes of a H9N2 Subtype Avian Influenza Virus Isolated from Guangdong
QI Yan,YUAN Run-yu,ZHANG He-nan,QI Wen-bao,SHAN Fen,HU Yue, LI Xiao-kang,JIAO Pei-rong,LIAO Ming.Cloning and Analysis of Full-length Genes of a H9N2 Subtype Avian Influenza Virus Isolated from Guangdong[J].Chinese Journal of Virology,2010,26(3).
Authors:QI Yan    YUAN Run-yu  ZHANG He-nan  QI Wen-bao  SHAN Fen  HU Yue  LI Xiao-kang  JIAO Pei-rong  LIAO Ming
Institution:QI Yan1,2,YUAN Run-yu1,ZHANG He-nan1,QI Wen-bao1,SHAN Fen1,HU Yue1,2 LI Xiao-kang1,JIAO Pei-rong1,LIAO Ming1,2 (1.College of Veterinary Medicine,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China,2.The Key Laboratory of Animal Disease Prevention and Control,Ministry of Agriculture,China)
Abstract:Eight full-length genes of an avian influenza virus Chinese isolate of H9N2 subtype,A/Chicken/Guangdong/HL/2006 (H9N2) (abbreviated as Ck/GD/HL/06),were amplified by RT-PCR,including the 5' and 3' non-coding region. All the genes were cloned and sequenced. The phylogenetic analysis results showed the HA gene of Ck/GD/HL/06 was located in the same phylogenetic clade as Dk/HK/Y280/97 (H9N2),while the Dk/HK/Y280/97-like viruses had been predominately isolated from chickens in mainland China. After the analysis...
Keywords:avian influenza  H9N2 subtype  full-length gene  cloning  sequence analysis  
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