| 中国西藏小反刍兽疫病毒野生株China/Tib/Gej/07-30基质蛋白基因和融合蛋白基因的分子特征分析 |
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| 引用本文： | 包静月,赵文姬,王志亮,李林,吴国珍,吴晓东,刘春菊,王君玮,刘雨田,李金明,王英丽.中国西藏小反刍兽疫病毒野生株China/Tib/Gej/07-30基质蛋白基因和融合蛋白基因的分子特征分析[J].病毒学报,2010(4). |
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| 作者姓名： | 包静月 赵文姬 王志亮 李林 吴国珍 吴晓东 刘春菊 王君玮 刘雨田 李金明 王英丽 |
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| 作者单位： | 中国动物卫生与流行病学中心国家外来动物疫病诊断中心;西藏动物疫病控制中心; |
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| 基金项目： | 农业部动物疫情监测项目,农业部948项目; 公益性行业(农业)科研专项经费 |
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| 摘 要： | 对我国西藏小反刍兽疫病毒野生株China/Tib/Gej/07-30进行基质蛋白(M)和融合蛋白(F)基因序列测定,并进行分子生物学特征分析。首先应用逆转录聚合酶链式反应扩增出M和F基因片段,对聚合酶链式反应产物进行直接测序,然后对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析。China/Tib/Gej/07-30的M基因由1483个核苷酸组成,编码335个氨基酸,与其他分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.4%～97.7%和97.0%～98.2%。F基因由2411个核苷酸组成,编码546个氨基酸,与其他分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为85.5%～96.1%和94.3%～98.2%。China/Tib/Gej/07-30的F蛋白含有信号肽序列和跨膜结构域,序列高度变异。F蛋白第104～108位和第109～133位氨基酸位点分别是高度保守的裂解位点和融合肽结构域。F蛋白还含有序列高度保守的三个七肽重复区。China/Tib/Gej/07-30的M基因3′端的非编码区(UTR)长度为443个核苷酸,GC含量高达68.4%,与其他PPRV毒株的同源性为82.4%～93.5%。China/Tib/Gej/07-30的F基因5′UTR区长度为634个核苷酸,GC含量高达70.0%,与其他PPRV毒株序列相似性为76.2%～91.7%。
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| 关 键 词： | 小反刍兽疫病毒 野生株 基质蛋白 融合蛋白 非编码区 核苷酸序列 |
Sequence Analysis of the Matrix Protein and Fusion Protein Genes of a Field Peste des Petits Ruminants Virus Strain from Tibet,China |
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| BAO Jing-yue,ZHAO Wen-ji,WANG Zhi-liang,LI Lin,WU Guo-zhen,WU Xiao-dong,LIU Chun-ju,WANG Jun-wei,LIU Yu-tian,LI Jin-ming,WANG Ying-li.Sequence Analysis of the Matrix Protein and Fusion Protein Genes of a Field Peste des Petits Ruminants Virus Strain from Tibet,China[J].Chinese Journal of Virology,2010(4). |
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| Authors: | BAO Jing-yue ZHAO Wen-ji WANG Zhi-liang LI Lin WU Guo-zhen WU Xiao-dong LIU Chun-ju WANG Jun-wei LIU Yu-tian LI Jin-ming WANG Ying-li |
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| Institution: | BAO Jing-yue1,ZHAO Wen-ji1,WANG Zhi-liang1,LI Lin1,WU Guo-zhen2,WU Xiao-dong1,LIU Chun-ju1,WANG Jun-wei1,LIU Yu-tian1,LI Jin-ming1,WANG Ying-li1(1.National Diagnostic Center for Exotic Animal Diseases,China Animal Health and Epidemiology Center,Qingdao 266032,China,2.Tibet Center for Animal Disease Control,Lasa 850000,China) |
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| Abstract: | The nucleotide sequences of M and F genes from a field strain of peste des petits ruminants virus(PPRV)(China/Tib/Gej/07-30)was firstly determined.The M gene was 1 483 nucleotides in length with a single open reading frame(ORF),encoding a protein of 335 amino acids.The F gene was 2411 nucleotides in length,encoding a protein of 546 amino acids.The resulting nucleotide sequence and the deduced amino acid sequences were compared with the homologous regions of other PPRV isolates.The nucleotide sequences of M ... |
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| Keywords: | peste des petits ruminants virus field strain matrix protein fusion protein untranslated region nucleotide sequence |
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