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水稻条纹病毒RNA4基因间隔区的分子变异
引用本文:魏太云,林含新,吴祖建,林奇英,谢联辉.水稻条纹病毒RNA4基因间隔区的分子变异[J].病毒学报,2001,17(2):144-149.
作者姓名:魏太云  林含新  吴祖建  林奇英  谢联辉
作者单位:福建农业大学植物病毒研究所,福建福州 350002
基金项目:国家自然科学基金资助项目(39670489);福建省自然科学基金资助项目(C97031)
摘    要:应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术快速检测我国水稻条纹病毒(RSV)RNA4基因间隔区(intergenic region,IR)的分子变异,结果表明,我国RSV RNA4 IR存在分子变异。供试的7个分离物共有4种泳动带型,其中YL、BS、JD、LY分离物完全一致,而YL、BS、YL及JD4个分离物序列完全一致;JN、PJ、SQ3个分离各不一样,序列之间的同源性均在92%-94%之间.IR序列内部具有两个重要的结构特征:(1)有两处反向重复序列,可形成两个明显的发夹结构,其中一个序列比较保守,形成的发夹结构稳定;但中一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大;(2)具有插入序列,相对于日本M分离物,我国7个分离物都有一段长19bp的插入序列,这段插入序列比较保守,各分离物之间仅有1-2个碱基的差异。

关 键 词:水稻条纹病毒  RNA4基因间隔区  PCR-SSCP  序列分析
文章编号:1000-8721(2001)02-0144-06

Molecular Variability of Intergenic Regions of Rice Stripe Virus RNA4
WEI Tai yun,LIN Han xin,WU Zu jian,LIN Qi ying,XIE Lian hui.Molecular Variability of Intergenic Regions of Rice Stripe Virus RNA4[J].Chinese Journal of Virology,2001,17(2):144-149.
Authors:WEI Tai yun  LIN Han xin  WU Zu jian  LIN Qi ying  XIE Lian hui
Abstract:
Keywords:Rice  stripe  virus  RNA4  intergenic  region  PCR  SSCP  sequence  analysis
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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