| 一株水貂博卡病毒全基因组扩增及序列分析 |
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| 引用本文： | 于永乐,姚延珠,张传美,秦志华,张洪亮,杨瑞梅,段笑笑,单虎.一株水貂博卡病毒全基因组扩增及序列分析[J].病毒学报,2022,38(2):439-447. |
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| 作者姓名： | 于永乐 姚延珠 张传美 秦志华 张洪亮 杨瑞梅 段笑笑 单虎 |
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| 作者单位： | 青岛农业大学动物医学院山东省预防兽医学重点实验室,青岛266109,青岛农业大学植物医学学院,青岛266109,青岛市动物疫病预防控制中心,青岛266000 |
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| 基金项目： | 在青高校服务青岛产业发展重点学科(兽医学)(项目;青岛农业大学高层次人才科研基金项目 |
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| 摘 要： | 本研究旨在研究水貂博卡病毒（Mink bocavirus,MBoV）在山东省的流行状况及基因特征。采用PCR对采自山东省境内水貂养殖场的85份水貂腹泻样品进行MBoV检测，挑选1份单阳性样品进行全基因扩增，使用MegAlign进行序列同源性比对分析，利用DNAMAN V6对基因组5’末端和3’末端回文结构进行预测，应用MEGA V6进行遗传进化分析。结果表明，所采集的腹泻样品中MBoV阳性率为3.5%(3/85)，其中1份为MBoV单阳性，2份为MBoV与水貂肠炎病毒（Mink enteritis virus,MEV）双阳性。获得MBoV全基因序列1条（SDMBoV2020），全长5 252 bp；经分析，5’-和3’-UTR分别由98和145 bp短回文序列组成，具有典型的细小病毒末端的茎环样结构；基因组含有3个ORFs，分别编码非结构蛋白NS1、NP1以及结构蛋白VP1和VP2;SDMBoV2020与NCBI登录的MBoV参考毒株KU950356各编码基因的推导氨基酸序列同源性较高，为98.5%～99.0%；基于MBoV全基因序列构建的系统发育进化树也显示，SDMBoV2020和参...
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| 关 键 词： | 水貂博卡病毒 基因组扩增 进化分析 |
Genome Amplification and Sequencing of the Mink Bocavirus |
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| YU Yongle,YAO Yanzhu,ZHANG Chuanmei,QIN Zhihua,ZHANG Hongliang,YANG Ruimei,DUAN Xiaoxiao,SHAN Hu.Genome Amplification and Sequencing of the Mink Bocavirus[J].Chinese Journal of Virology,2022,38(2):439-447. |
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| Authors: | YU Yongle YAO Yanzhu ZHANG Chuanmei QIN Zhihua ZHANG Hongliang YANG Ruimei DUAN Xiaoxiao SHAN Hu |
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