| 柯萨奇病毒A组9型的基因分型方法的建立 |
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| 引用本文： | 赵鹤鹤,冀天娇,杨倩,肖金波,祝双利,王东艳,王建醒,陈建华,路环环,韩振志,张勇,许文波,严冬梅.柯萨奇病毒A组9型的基因分型方法的建立[J].病毒学报,2022,38(2):264-270. |
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| 作者姓名： | 赵鹤鹤 冀天娇 杨倩 肖金波 祝双利 王东艳 王建醒 陈建华 路环环 韩振志 张勇 许文波 严冬梅 |
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| 作者单位： | 国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206,山东省疾病预防控制中心,济南250014,甘肃省疾病预防控制中心,兰州730000,国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206;中国科学院生物安全大科学研究中心,北京102206 |
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| 基金项目： | 北京市自然科学基金(项目号：L192014)，题目：EVA71疫苗大规模应用后对我国手足口病病原谱的影响及其保护效果评价研究；;国家重点研发计划(项目号：2021YFC0863000)，题目：新型冠状病毒冷链传播机制和低温消毒技术研究~~； |
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| 摘 要： | 血清型别鉴定及基因分型分析是开展肠道病毒（Enterovirus,EV）分子进化特征研究的重要内容。目前为止，国内外对柯萨奇病毒A组9型（Coxsackievirus A9,CVA9）的研究主要集中在衣壳蛋白区的细胞受体结合位点及其基因特性分析，而基于全长VP1序列的基因型划分结果尚未明确。本研究依托国家手足口病监测网络，对2010-2019年全国31个省级行政区（省、自治区、直辖市）上送的18 238份手足口病样本中分离出的24株CVA9进行全长VP1区序列测定，并与GenBank中所有全长VP1区序列一起进行基因型划分研究。测序结果显示24株CVA9分离株VP1全长为906bp，编码302个氨基酸，与CVA9原型株（Griggs）核苷酸和氨基酸相似性分别为80.5%～97.6%和92.3%～99.6%。结合系统进化树和同一血清型内不同基因型的核苷酸差异界值为15%～25%，将全球CVA9划分为A-H八个基因型。进化树显示B、C和D基因型在病毒进化过程中已消失，而E、F和G基因型呈现共循环的趋势，其中G基因型包含了亚洲、北美洲、大洋洲和欧洲等9个国家的毒株，是CVA9的优势基因型。大...
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| 关 键 词： | 柯萨奇病毒A组9型(CVA9) 基因分型 分子进化 |
Establishment of A Genotyping Method for Coxsackievirus A 9 |
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| ZHAO Hehe,JI Tianjiao,YANG Qian,XIAO Jinbo,ZHU Shuangli,WANG Dongyan,WANG Jianxing,CHEN Jianhua,LU Huanhuan,HAN Zhenzhi,ZHANG Yong,XU Wenbo,YAN Dongmei.Establishment of A Genotyping Method for Coxsackievirus A 9[J].Chinese Journal of Virology,2022,38(2):264-270. |
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| Authors: | ZHAO Hehe JI Tianjiao YANG Qian XIAO Jinbo ZHU Shuangli WANG Dongyan WANG Jianxing CHEN Jianhua LU Huanhuan HAN Zhenzhi ZHANG Yong XU Wenbo YAN Dongmei |
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