| 深圳市一株境外输入新型冠状病毒C.1.2变异株的分子特征分析 |
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| 引用本文： | 屈雅丽,陈龙,许文波,张仁利,聂凯,牛培华,陈建成,冯晔囡,武伟华,彭博,魏欣仪,李诗敏,吕秋莹,李玥,邓少玉,胡贵方,何雅青.深圳市一株境外输入新型冠状病毒C.1.2变异株的分子特征分析[J].病毒学报,2022,38(2):278-283. |
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| 作者姓名： | 屈雅丽 陈龙 许文波 张仁利 聂凯 牛培华 陈建成 冯晔囡 武伟华 彭博 魏欣仪 李诗敏 吕秋莹 李玥 邓少玉 胡贵方 何雅青 |
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| 作者单位： | 南方医科大学公共卫生学院流行病学系,广州510515,深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所,深圳518055,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206,深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所,深圳5180553,南方医科大学公共卫生学院流行病学系,广州510515;深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所,深圳518055 |
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| 基金项目： | 深圳市科技创新委员会技术攻关面上项目;深圳市科技创新委员会技术攻关重点项目 |
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| 摘 要： | 为了了解境外输入的新型冠状病毒（SARS-CoV-2）变异株的分子特征，本研究对2021年6月深圳市一株从南非输入的SARS-CoV-2毒株进行了全基因组测序和序列分析。Illumina测序技术获得的SARS-CoV-2毒株基因组长度为29 567nt。根据"Pango lineages"分型法，本研究测定的毒株属于C.1.2系，该谱系属世界卫生组织定义的监测变异株（Variants Under Monitoring,VUM）成员之一。与参考株Wuhan-Hu-1(NC＿045512.2)比较，本研究C.1.2系毒株共出现了58个核苷酸变异位点，其中56个变异位点位于编码区。氨基酸变异位点共有33个，氨基酸变异位点分布于6个开放阅读框，变异数由多到少依次为：S蛋白区12个，ORFlab蛋白区9个，ORF3a蛋白区2个，M区2个，ORF8区2个，E区1个。本研究测定的SARS-CoV-2毒株属我国大陆首例境外输入的C.1.2变异株。开展境外输入的SARS-CoV-2毒株基于基因组测序的分子监测，对防控由境外输入的SARS-CoV-2变异株引起本地新型冠状病毒肺炎（COVID-19）暴发与...
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| 关 键 词： | SARS-CoV-2 C.1.2变异株 深圳地区 基因组序列 |
Molecular Characterization of An Imported SARS-CoV-2 Strain C.1.2 in Shenzhen,China |
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| QU Yali,CHEN Long,XU Wenbo,ZHANG Renli,NIE Kai,NIU Peihua,CHEN Jiancheng,FENG Yenan,WU Weihua,PENG Bo,WEI Xinyi,LI Shimin,LYU Qiuying,LI Yue,DENG Shaoyu,HU Guifang,HE Yaqing.Molecular Characterization of An Imported SARS-CoV-2 Strain C.1.2 in Shenzhen,China[J].Chinese Journal of Virology,2022,38(2):278-283. |
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| Authors: | QU Yali CHEN Long XU Wenbo ZHANG Renli NIE Kai NIU Peihua CHEN Jiancheng FENG Yenan WU Weihua PENG Bo WEI Xinyi LI Shimin LYU Qiuying LI Yue DENG Shaoyu HU Guifang HE Yaqing |
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