长白县黑线姬鼠携带汉坦病毒的S基因特征研究 |
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引用本文: | 燕清丽,杨鹏飞,邵丽筠,刘勇先,浦昀,张晓龙,曹晓梅,郭天宇,姚李四.长白县黑线姬鼠携带汉坦病毒的S基因特征研究[J].病毒学报,2013(4):382-385. |
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作者姓名: | 燕清丽 杨鹏飞 邵丽筠 刘勇先 浦昀 张晓龙 曹晓梅 郭天宇 姚李四 |
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作者单位: | 中国检验检疫科学研究院卫生检疫研究所;吉林出入境检验检疫局;长白出入境检验检疫局 |
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基金项目: | 国家质检总局质检公益项目(NO.2011IK150);公益性科研院所基础研究基金项目(2011JK008) |
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摘 要: | 为了解长白县黑线姬鼠中汉坦病毒流行情况及病毒型别,采用巢式RT-PCR方法筛查鼠肺RNA,并对PCR阳性样本进行全S基因的扩增、克隆及测序;构建系统发生树并进行分子进化分析。结果显示:共捕获黑线姬鼠58只,共检测出4份阳性标本,阳性率6.90%。经过序列测定及进化分析显示黑线姬鼠所携带的病毒与汉滩病毒第6基因亚型标准株核苷酸的同源性为95.8%~96.3%,氨基酸同源性为98.6%~99.5%。同时发现,长白县黑线姬鼠携带的汉滩病毒的NP蛋白共有1个特异性氨基酸位点为S387。
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关 键 词: | 汉滩病毒 RT-PCR 系统进化 基因分型 |
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