鸭甲肝病毒3型2012年山东分离株VP1基因的序列分析 |
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引用本文: | 徐倩,陈琳琳,张瑞华,杨蕾,谢之景,朱岩丽,姜世金,司兴奎.鸭甲肝病毒3型2012年山东分离株VP1基因的序列分析[J].病毒学报,2013(5):522-528. |
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作者姓名: | 徐倩 陈琳琳 张瑞华 杨蕾 谢之景 朱岩丽 姜世金 司兴奎 |
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作者单位: | 山东农业大学动物医学院;山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室;佛山科学技术学院动物医学系 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30871878);山东省高等学校科技计划项目(J08LF07);山东省科技发展计划项目(2010GNC10914) |
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摘 要: | 为揭示近年来鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)中国分离株VP1基因的遗传变异规律,本研究对2012年从山东省分离到的13株DHAV-3的VP1基因分别进行PCR扩增、序列测序与分析。结果显示,13株DHAV-3的VP1基因均由720个核苷酸组成,共编码240个氨基酸,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为94.6%~99.9%和95.0%~100%。与GenBank中公布的31株DHAV-3的VP1基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.5%~100%和90.8%~100%。系统进化分析显示,DHAV-3可分为两个基因型,其中除疫苗毒B63之外所有中国分离株均属于GⅠ型,越南分离毒株主要属于GⅡ型S1亚型,而韩国分离株组成GⅡ型中的S2亚型,具有明显的地域特征。
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关 键 词: | DHAV-3 VP1基因 序列分析 GenBank |
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