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基于生活污水监测的诺如病毒分子流行病学研究
引用本文:刘姗姗,陶泽新,王素婷,周楠,林小娟,宋艳艳,徐爱强.基于生活污水监测的诺如病毒分子流行病学研究[J].病毒学报,2018,34(3):342-348.
作者姓名:刘姗姗  陶泽新  王素婷  周楠  林小娟  宋艳艳  徐爱强
作者单位:山东大学 公共卫生学院,济南,250012;山东省疾病预防控制中心 山东大学 预防医学研究院 山东省传染病预防控制重点实验室,济南,250014;山东大学 公共卫生学院,济南 250012;山东省疾病预防控制中心 山东大学 预防医学研究院 山东省传染病预防控制重点实验室,济南 250014
摘    要:为了解生活污水中诺如病毒(Norovirus,NoV)检出情况、基因型分布和分子流行病学特征,进一步探索环境监测技术用于研究病毒性胃肠炎病原区域性流行的必要性,本研究于2016年1~12月在山东省济南和临沂两地采集生活污水,通过阴离子膜吸附洗脱法对收集到的24份污水样品进行浓缩后,提取核酸,经过逆转录-聚合酶链反应扩增NoV VP1基因片段,经TA克隆后测序,进行分型和系统进化树分析。结果显示,监测地区生活污水标本中GⅠ的检出率为100%,GⅡ为95.8%。共获得412条NoV序列,分别属于6个GⅠ基因型和8个GⅡ基因型,其中GⅠ.6(32.3%,133/412)、GⅡ.3(14.1%,58/412)和GⅡ.17(25.7%,106/412)检出数量最多。GⅡ.17检出序列均属于Kawasaki 308变异株,而前些年大流行的GⅡ.4的检出序列占比仅1.0%,属于Sydney 2012变异株。本研究描述了2016年山东省本地流行的诺如病毒基因型分布和序列特征,证明了可以通过对城市污水进行监测来探索人群中循环的诺如病毒的遗传多样性。

关 键 词:急性胃肠炎  诺如病毒  分子流行病学  环境监测  生活污水
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