我国肾综合出血热疫苗生产株LR1株的基因组序列分析

为测定我国肾综合征出血热疫苗生产株LR1株的全基因组序列，了解该株分子基础，从提纯的细胞总RNA逆转录PCR扩增，产物纯化后克隆T载体纯化后测序，结果证明，LR1株全基因组序列由L6533、M3616、S片段的1692个核苷酸组成，依各自读码框架分别编码21511、1135、429个氨基酸。序列同源比较分析表明，LR1毒株与国外HTN型毒株高度同源，属同一亚型，尤其与HTN代表株75－1183个片段同源率高达99．3％－99．8％，而与国内的HTN型病毒差异较大，同源率仅为79．4％－84．6％。氨基酸比较也显示了同样的结果。