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斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用
引用本文:张积森,李伟,阙友雄,阮妙鸿,张木清,陈如凯.斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用[J].热带亚热带植物学报,2007,15(4):277-283.
作者姓名:张积森  李伟  阙友雄  阮妙鸿  张木清  陈如凯
作者单位:1. 福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室,福州,350002;福建师范大学生命科学学院,福州,350108
2. 福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室,福州,350002
基金项目:国家自然科学基金;高等学校博士学科点专项科研项目
摘    要:根据已发表的同源基因序列,利用RT-PCR技术分离了斑茅(Erianthus arundinaceus)的GAPDH和APRT两个看家基因片段,用它们作为cDNA芯片阳性参照,以未经聚乙二醇(PEG)胁迫处理的斑茅叶片为对照,和PEG胁迫的4组材料同cDNA芯片进行杂交分析。杂交结果显示,GAPDH杂交的Cy5与Cy3平均信噪比(Signal/Noise,S/N)分别为56.12和60.8,APRT杂交的Cy5与Cy3平均信噪比分别为51.06和47.25,信噪比均很高;同时两个看家基因的杂交都显示出极强的信号,其中GAPDH的杂交信号值大于10000,APRT也在8000以上,杂交结果可靠。分析了PEG胁迫4个时段BADH与两个看家基因的表达,BADH的表达有明显变化,而看家基因表达均较稳定。上述结果表明所克隆的两个看家基因在斑茅中表达量高,且PEG胁迫下表达较为稳定,是基因芯片理想的阳性参照。

关 键 词:斑茅  看家基因  基因芯片
文章编号:1005-3395(2007)04-0277-07
收稿时间:2006-12-28
修稿时间:2006-12-282007-03-15

Cloning of Two House-keeping Genes from Erianthus arundinaceus and the application in cDNA microarray
Zhang Ji-sen,Li Wei,Que You-xiong,RuanMiao-hong,Zhang Mu-qing,Chen Ru-Kai.Cloning of Two House-keeping Genes from Erianthus arundinaceus and the application in cDNA microarray[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2007,15(4):277-283.
Authors:Zhang Ji-sen  Li Wei  Que You-xiong  RuanMiao-hong  Zhang Mu-qing  Chen Ru-Kai
Abstract:
Keywords:PEG
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