首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
   检索      

湿地松木质部和针叶松脂合成基因分析
引用本文:张文娟,谷振军,胡珊,张志红,李火根,杨春霞.湿地松木质部和针叶松脂合成基因分析[J].热带亚热带植物学报,2023,31(4):531-540.
作者姓名:张文娟  谷振军  胡珊  张志红  李火根  杨春霞
作者单位:南京林业大学, 林木遗传与生物技术教育部重点实验室, 南方现代林业创新中心, 南京 210037;江西省林业科学院林木遗传育种与栽培研究所, 南昌 330032;峡江县林木良种场, 江西 吉安 331409
基金项目:国家自然科学基金项目(32160389);江西林业科学院青年科技人才培养项目(2021522901)资助
摘    要:为挖掘湿地松(Pinus elliottii)松脂合成相关的基因,对不同采脂期的木质部和针叶进行高通量转录组测序,与火炬松(Pinus taeda)参考基因组进行比对,共获得了68 211条unigenes,546 356 450条clean reads,平均比对率达90.21%。将不同时期木质部、木质部与针叶间进行两两对比,以P<0.05,|log2FoldChange|>1.0为标准来筛选差异基因,并进行GO和KEGG富集分析。结果表明,参与萜类物质合成的差异基因有133个,其中大部分富集在MEP途径,从差异基因中挑选8个产脂相关的候选基因进行RT-qPCR验证,确定HMGR、DXS、TPS、ABC转运蛋白基因与产脂存在关联性。通过转录组测序与分析,挖掘出133个参与松脂萜类物质合成相关的差异基因,其中萜烯合酶基因(TPS)和ABC转运基因在正调控萜类物质合成中发挥关键作用。

关 键 词:湿地松  松脂  转录组  产脂候选基因
收稿时间:2022/6/17 0:00:00
修稿时间:2022/7/25 0:00:00

Genes Related to Resin Biosynthesis in Xylem and Needle of Pinus elliottii
ZHANG Wenjuan,GU Zhengjun,HU Shan,ZHANG Zhihong,LI Huogeng,YANG Chunxia.Genes Related to Resin Biosynthesis in Xylem and Needle of Pinus elliottii[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2023,31(4):531-540.
Authors:ZHANG Wenjuan  GU Zhengjun  HU Shan  ZHANG Zhihong  LI Huogeng  YANG Chunxia
Institution:Key Laboratory of Forest Genetics & Biotechnology of Ministry of Education, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China;Institute of Forest Genetic Breeding and Cultivation, Jiangxi Academy of Forestry, Nanchang 330032, China;Xiajiang County Forest Seed Farm, Ji''an 331409, Jiangxi, China
Abstract:
Keywords:
点击此处可从《热带亚热带植物学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《热带亚热带植物学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号