| 基于RAD-SNPs分析的四川核桃良种资源的遗传多样性研究 |
| |
| 引用本文： | 闫思宇,朱鹏,龚伟,王景燕,吴开志,吴春艳,李海平,龚毅红,段琼.基于RAD-SNPs分析的四川核桃良种资源的遗传多样性研究[J].热带亚热带植物学报,2019,27(1):19-28. |
| |
| 作者姓名： | 闫思宇 朱鹏 龚伟 王景燕 吴开志 吴春艳 李海平 龚毅红 段琼 |
| |
| 作者单位： | 四川农业大学林学院;四川省林木种苗站 |
| |
| 基金项目： | 四川省林业厅种苗站项目（20140312）；四川省科技厅项目（2016NYZ0035，2017NFP0051，2017NFP0126）；四川省农业科技成果转化项目（16NZ0067）；四川农业大学新农村发展研究院雅安服务总站项目（2017-05）资助 |
| |
| 摘 要： | 为了解四川核桃(Juglans)种质资源的遗传多样性,利用RAD二代测序技术对42份核桃良种资源进行测序,分析其遗传结构和遗传多样性。结果表明,共获得70G clean data,Q30平均为96.3%,并获得160 309个多态性SNPs。聚类、遗传结构和主成分分析结果高度一致,42份种质资源聚为两大类,基本反映了两个原始祖先血统,即普通核桃类(AJR,33份)和泡核桃类(AJS,9份),两类群具较高的遗传分化(FST=0.285),且分类与地理位置分布和种群相关;且修正了‘威薄01’、‘白龙1号’和‘石棉巨核’3个品种的类群认定。AJS和AJR类群中分别有9和14个良种为纯血统且亲缘关系较远,而其余的良种均为两个血统的混杂。42个核桃良种资源的核苷酸多样性Pi(π)]和期望杂合度(He)分别为0.029和0.286,表明这些资源具有丰富的遗传多样性,相对于AJR类群,AJS类群的杂合率(He)与核苷酸多态性更大,而SNP数更少,AJS遗传多样性更丰富。这些为四川的核桃种质资源保存和杂交育种研究奠定了基础。
|
| 关 键 词： | RAD-SNP 普通核桃 泡核桃 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2018/3/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/5/9 0:00:00 |
Studies on Genetic Diversity of Juglans Cultivar Germplasms in Sichuan Based on RAD-SNPs Analysis |
| |
| YAN Si-yu,ZHU Peng,GONG Wei,WANG Jing-yan,WU Kai-zhi,WU Chun-yan,LI Hai-ping,GONG Yi-hong and DUAN Qiong.Studies on Genetic Diversity of Juglans Cultivar Germplasms in Sichuan Based on RAD-SNPs Analysis[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2019,27(1):19-28. |
| |
| Authors: | YAN Si-yu ZHU Peng GONG Wei WANG Jing-yan WU Kai-zhi WU Chun-yan LI Hai-ping GONG Yi-hong and DUAN Qiong |
| |
| Institution: | College of Forestry, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China,College of Forestry, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China,College of Forestry, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China,College of Forestry, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China,Forest Seedling Station of Sichuan Province, Chengdu 610081, China,Forest Seedling Station of Sichuan Province, Chengdu 610081, China,Forest Seedling Station of Sichuan Province, Chengdu 610081, China,Forest Seedling Station of Sichuan Province, Chengdu 610081, China and Forest Seedling Station of Sichuan Province, Chengdu 610081, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | RAD-SNP Juglans sigillata J regia Genetic diversity |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《热带亚热带植物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《热带亚热带植物学报》下载免费的PDF全文 |
|
