| 弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析 |
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| 引用本文： | 韩雨昕,南芳茹,巩超彦,冯佳,吕俊平,刘琪,谢树莲.弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析[J].热带亚热带植物学报,2019,27(1):36-44. |
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| 作者姓名： | 韩雨昕 南芳茹 巩超彦 冯佳 吕俊平 刘琪 谢树莲 |
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| 作者单位： | 山西大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31670208，31370239）资助 |
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| 摘 要： | 为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征,选取弯枝藻属(Compsopogon)及相近外类群的rbc L基因共17条,利用PAML 4.9软件,对弯枝藻属rbc L基因编码蛋白进行生物信息学分析,并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测。结果表明,弯枝藻属rbc L基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成,结构稳定。采用最大似然法构建的系统发育树表明,内类群为单一物种,分为3个小分支,具有一定地理分布规律。在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点,表明绝大多数位点处于负选择压力下。因此,弯枝藻属rbc L基因未发生适应性进化。
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| 关 键 词： | 弯枝藻属 rbcL基因 蛋白质结构预测 适应性进化 |
| 收稿时间： | 2018/3/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/4/29 0:00:00 |
Adaptive Evolutionary Analysis of the rbcL Gene from Compsopogon (Rhodophyta) |
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| HAN Yu-xin,NAN Fang-ru,GONG Chao-yan,FENG Ji,L&#; Jun-ping,LIU Qi and XIE Shu-lian.Adaptive Evolutionary Analysis of the rbcL Gene from Compsopogon (Rhodophyta)[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2019,27(1):36-44. |
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| Authors: | HAN Yu-xin NAN Fang-ru GONG Chao-yan FENG Ji L&#; Jun-ping LIU Qi and XIE Shu-lian |
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| Institution: | School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China and School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Compsopogon rbcL gene Protein structure prediction Adaptive evolution |
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