| 地果的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 石登红,王继玥,白禹,张婷,刘燕,欧阳柏成.地果的转录组学分析[J].热带亚热带植物学报,2020,28(4):317-328. |
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| 作者姓名： | 石登红 王继玥 白禹 张婷 刘燕 欧阳柏成 |
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| 作者单位： | 贵阳学院生物与环境工程学院, 贵阳 550005;贵阳学院生物与环境工程学院, 贵阳 550005;贵州省山地珍稀动物与经济昆虫重点实验室, 贵阳 550005;贵阳学院数学与信息工程学院, 贵阳 550005 |
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| 基金项目： | Project of China Scholarship Council (LJF[2017]50863), Program for National Innovation Training of Undergraduate (2018109760007, 2018109760008), Program for First-class Discipline Construction in Guizhou Province (QJKYF[2017]85), Project for Science and Technology of Guizhou Province (QKHJC[2017]1004), Project for Major Research by Innovation Group in Guizhou Education Department (QJHKY[2018]027), Project for Provincial Key Discipline of Ecology (ZDXK[2013]08), Project for Cooperative Base for Production, Education and Research of Organic Vegetable Ecological Cultivation and Breeding (KY[2013]125), Program for Innovative Training of Undergraduate in Guizhou (2018520777, 2018520778, 2018520831, 2018520861, 20195200341, 20195201373), Program for Educational Incubation of Guiyang University (GYU-KJT[2019]-06, GYU-KJT[2019]-07), and Discipline and Master''s Site Construction Project of Guiyang University by Guiyang City Financial Support Guiyang University (SH-2020) |
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| 摘 要： | 为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱。结果表明,共获得了197 362个转录本,总长度和平均长度分别为114 072 125和577 bp。使用BlastX和BlastN共注释了139 992个转录本(占总数的70.93%)。从3个品种叶片和茎的6对样品中,分别鉴定了12 397、12 340、10 373、94 431、71 830和44 465个差异表达基因,以及注释了126、129、125、134、138和137条代谢途径。这将有助于理解地果的遗传特征,以及不同组织中代谢途径的变化。
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| 关 键 词： | 转录组 地果 RNA-seq 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2019/10/6 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/12/4 0:00:00 |
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