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橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析
引用本文:赖瑞联,陈瑾,冯新,程春振,韦晓霞,陈义挺,吴如健.橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析[J].热带亚热带植物学报,2018,26(6):571-579.
作者姓名:赖瑞联  陈瑾  冯新  程春振  韦晓霞  陈义挺  吴如健
作者单位:福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013,福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013,福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013,福建农林大学园艺植物生物工程研究所, 福州 350002,福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013,福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013,福建省农业科学院果树研究所, 福州 350013
基金项目:福建省属公益类科研院所基本科研专项(2018R1013-3,2016R1013-15);农业部物品种资源保护费(热带作物)项目(151721301354051701)资助
摘    要:为了解橄榄(Canarium album)抗寒相关转录因子ICE1的调控功能,采用RT-PCR技术克隆了‘福榄1号’的ICE1,命名为CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析。结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1 650 bp,可编码549个氨基酸(GenBank登录号MG459422)。Ca ICE1为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域,定位于细胞核,与枳的ICE1亲缘关系较近。CaICE1密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群。CaICE1主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下CaICE1表达水平比常温显著上升。psRNAtarget预测结果表明,CaICE1可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因。因此,CaICE1可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受miRNA的调控。

关 键 词:橄榄  抗寒  转录因子  ICE1  克隆  基因表达
收稿时间:2018/1/12 0:00:00
修稿时间:2018/3/6 0:00:00

Cloning and Expression Analysis of the CaICE1 Gene in Canarium album
LAI Rui-lian,CHEN Jin,FENG Xin,CHENG Chun-zhen,WEI Xiao-xi,CHEN Yi-ting and WU Ru-jian.Cloning and Expression Analysis of the CaICE1 Gene in Canarium album[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2018,26(6):571-579.
Authors:LAI Rui-lian  CHEN Jin  FENG Xin  CHENG Chun-zhen  WEI Xiao-xi  CHEN Yi-ting and WU Ru-jian
Institution:Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China,Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China,Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China,Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China,Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China,Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China and Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China
Abstract:
Keywords:
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