| 应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢 |
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| 引用本文： | 叶超,徐楠,陈修来,刘立明.应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢[J].生物工程学报,2019,35(10):1901-1913. |
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| 作者姓名： | 叶超 徐楠 陈修来 刘立明 |
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| 作者单位： | 1 江南大学 食品科学与技术国家重点实验室，江苏 无锡 214122;2 江南大学 工业生物技术教育部重点实验室，江苏 无锡 214122,3 扬州大学 生物科学与技术学院，江苏 扬州 225009,1 江南大学 食品科学与技术国家重点实验室，江苏 无锡 214122;2 江南大学 工业生物技术教育部重点实验室，江苏 无锡 214122,1 江南大学 食品科学与技术国家重点实验室，江苏 无锡 214122;2 江南大学 工业生物技术教育部重点实验室，江苏 无锡 214122 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划 (No. 2018YFA0901401)，2018年“万人计划”科技创新领军人才支持经费，国家自然科学基金 (No. 21808083)，江苏省科技支撑计划社会发展项目 (Nos. BE2018623, BE2017622)，广东省重点领域研发计划项目 (No. 2019B020218001) 资助。 |
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| 摘 要： | 为了快速、高效地理解工业微生物胞内代谢特征,寻找潜在的代谢工程改造靶点,基因组规模代谢网络模型(GSMM)作为一种系统生物学工具越来越受到人们的关注。文中在回顾GSMM 20年发展历程的基础上,分析了当前GSMM的研究现状,总结了GSMM的构建及分析方法,从预测细胞表型和指导代谢工程两个方面阐述了GSMM在解析工业微生物胞内代谢中的应用,并展望了GSMM未来的发展趋势。
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| 关 键 词： | 微生物胞内代谢，生产性能，基因组规模代谢网络模型，系统生物学 |
| 收稿时间： | 2019/6/16 0:00:00 |
Application of metabolic network model to analyze intracellular metabolism of industrial microorganisms |
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| Chao Ye,Nan Xu,Xiulai Chen and Liming Liu.Application of metabolic network model to analyze intracellular metabolism of industrial microorganisms[J].Chinese Journal of Biotechnology,2019,35(10):1901-1913. |
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| Authors: | Chao Ye Nan Xu Xiulai Chen and Liming Liu |
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| Institution: | 1 State Key Laboratory of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China;2 Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China,3 College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, Jiangsu, China,1 State Key Laboratory of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China;2 Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China and 1 State Key Laboratory of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China;2 Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, Jiangnan University, Wuxi 214122, Jiangsu, China |
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| Abstract: | To quickly and efficiently understand the intracellular metabolic characteristics of industrial microorganisms, and to find potential metabolic engineering targets, genome-scale metabolic network models (GSMMs) as a systems biology tool, are attracting more and more attention. We review here the 20-year history of metabolic network model, analyze the research status and development of GSMMs, summarize the methods for model construction and analysis, and emphasize the applications of metabolic network model for analyzing intracellular metabolic activity of microorganisms from cellular phenotypes, and metabolic engineering. Furthermore, we indicate future development trend of metabolic network model. |
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| Keywords: | intracellular metabolic activity of microorganisms production performance genome-scale metabolic model systems biology |
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