| 短胶法预处理含高浓度去垢剂的蛋白样品 |
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| 引用本文： | 马首智,张涛,翟琳辉,孙玉琳,徐平,赵晓航.短胶法预处理含高浓度去垢剂的蛋白样品[J].生物工程学报,2014,30(9):1446-1453. |
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| 作者姓名： | 马首智 张涛 翟琳辉 孙玉琳 徐平 赵晓航 |
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| 作者单位： | 1 北京协和医学院 中国医学科学院肿瘤研究所 分子肿瘤学国家重点实验室，北京 100021;2 军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850；3 北京蛋白质组研究中心，北京 102206;2 军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850；3 北京蛋白质组研究中心，北京 102206;1 北京协和医学院 中国医学科学院肿瘤研究所 分子肿瘤学国家重点实验室，北京 100021;2 军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850；3 北京蛋白质组研究中心，北京 102206;1 北京协和医学院 中国医学科学院肿瘤研究所 分子肿瘤学国家重点实验室，北京 100021；4 海军总医院基础医学研究中心，北京 100048 |
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| 基金项目： | 国家高技术发展计划 (863计划) (No. 2012AA020206), 国家自然科学基金 (Nos. 31070673, 31170780, 81372591, 91029725), 北京市自然科学基金 (No. 5112012) 资助。 |
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| 摘 要： | 蛋白质组学研究中常使用含高浓度去垢剂的缓冲液以提高蛋白提取效率,但这种缓冲液会对下游蛋白质定量、酶解、质谱分析等步骤造成干扰。短胶法可用于含高浓度去垢剂样品的预处理,文中进一步评价了短胶法(Short gel)用于含高去垢剂的蛋白样品定量和预处理的效果。使用牛血清白蛋白作为标准蛋白分析了短胶法定量的线性范围,结果发现短胶法定量的线性范围为1-8μg,提示可对这一范围内的样品蛋白进行定量检测。对标准蛋白定量的线性度达到0.999,且重复性好,不容易受到蛋白表达模式变化的影响,结果可靠。短胶法定量的蛋白可通过胶内酶解,直接进行液相色谱-质谱联用(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)分析,质谱信号较好。结果提示直接用短胶法预处理含高浓度去垢剂的蛋白样品,值得在蛋白质组学研究中推广。
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| 关 键 词： | 短胶法 液质联用 蛋白质组学 蛋白定量 |
| 收稿时间： | 2013/12/19 0:00:00 |
Short gel method for pretreatment of protein samples with high concentration of detergent |
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| Shouzhi M,Tao Zhang,Linhui Zhai,Yulin Sun,Ping Xu and Xiaohang Zhao.Short gel method for pretreatment of protein samples with high concentration of detergent[J].Chinese Journal of Biotechnology,2014,30(9):1446-1453. |
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| Authors: | Shouzhi M Tao Zhang Linhui Zhai Yulin Sun Ping Xu and Xiaohang Zhao |
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| Institution: | 1 State Key Laboratory of Molecular Oncology, Cancer Hospital & Institute, Peking Union Medical College & Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100021, China;2 Institute of Radiation Medicine, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100850, China; 3 Beijing Proteome Research Center, Beijing 102206, China;2 Institute of Radiation Medicine, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100850, China; 3 Beijing Proteome Research Center, Beijing 102206, China;1 State Key Laboratory of Molecular Oncology, Cancer Hospital & Institute, Peking Union Medical College & Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100021, China;2 Institute of Radiation Medicine, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100850, China; 3 Beijing Proteome Research Center, Beijing 102206, China;1 State Key Laboratory of Molecular Oncology, Cancer Hospital & Institute, Peking Union Medical College & Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100021, China; 4 Center of Basic Medical Science, Navy General Hospital, Beijing 100048, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | short gel LC-MS/MS proteomics protein quantitation |
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