| 芥菜WOX基因家族的全基因组鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 阳文龙,徐楚,韩嘉琪,张晓辉,宋江萍,贾会霞,王海平.芥菜WOX基因家族的全基因组鉴定与分析[J].生物工程学报,2023,39(2):537-551. |
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| 作者姓名： | 阳文龙 徐楚 韩嘉琪 张晓辉 宋江萍 贾会霞 王海平 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所, 北京 100081;中国农业科学院蔬菜花卉研究所, 北京 100081;山西农业大学, 山西 太谷 030801 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目（CARS-24-A-01）；中国农业科学院创新工程项目（CAAS-ASTIP-2022-IVFCAAS）；国家园艺种质北京蔬菜分库运行服务项目（NHGRC2022-NH01） |
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| 摘 要： | WUSCHEL相关-同源盒(WUSCHEL related-homeobox, WOX)基因家族是一类植物特有的转录因子基因家族，在植物的生长发育过程中发挥重要作用。本研究利用芥菜(Brassica juncea)基因组数据，通过HUMMER、Smart等软件进行检索筛选，共鉴定出51个WOX基因家族成员。利用Expasy在线软件对这些家族成员的蛋白质分子量、氨基酸序列长度、等电点等进行分析，并利用生物信息学软件对芥菜WOX基因家族进化关系、保守区域、基因结构等进行系统性分析，将芥菜WOX基因家族分为古老支、中间支和WUS支/现代支3个亚家族。结构分析表明，同一亚家族内的WOX转录因子家族成员的保守结构域的种类、组织形式以及基因结构具有高度的一致性，而不同亚家族之间呈现一定的多样性。51个WOX基因不均匀分布于芥菜18条染色体上，这些基因的启动子大多含有响应光、激素和非生物逆境胁迫相关的顺式作用元件。利用转录组数据和实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR)分析发现，芥菜WOX基因的表达具有时空特异性，其中B...
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| 关 键 词： | 芥菜 WOX基因家族 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2022/9/26 0:00:00 |
Genome-wide identification and characterization of the WOX gene family in Brassica juncea |
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| YANG Wenlong,XU Chu,HAN Jiaqi,ZHANG Xiaohui,SONG Jiangping,JIA Huixi,WANG Haiping.Genome-wide identification and characterization of the WOX gene family in Brassica juncea[J].Chinese Journal of Biotechnology,2023,39(2):537-551. |
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| Authors: | YANG Wenlong XU Chu HAN Jiaqi ZHANG Xiaohui SONG Jiangping JIA Huixi WANG Haiping |
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| Institution: | Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China;Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China;Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica juncea WOX gene family bioinformatics analysis |
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