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玉米早期花药蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析
引用本文:张智敏,叶娟英,龙海飞,洪玥,陆平利.玉米早期花药蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析[J].生物工程学报,2016,32(7):937-955.
作者姓名:张智敏  叶娟英  龙海飞  洪玥  陆平利
作者单位:复旦大学 生命科学学院 植物科学研究所,上海 200438,复旦大学 生命科学学院 植物科学研究所,上海 200438,复旦大学 生命科学学院 植物科学研究所,上海 200438,复旦大学 生命科学学院 植物科学研究所,上海 200438,复旦大学 生命科学学院 植物科学研究所,上海 200438
基金项目:上海市浦江人才计划 (No. 14PJ1400900) 资助。
摘    要:蛋白质磷酸化修饰是调控其功能的一种重要方式。植物有性生殖过程在农作物产量形成和物种繁衍过程中起着重要作用。作为植物雄性生殖器官的花药,其正常生长发育对于保证形成功能性配子(花粉)以及完成双受精过程至关重要。本研究以重要农作物玉米(B73)为材料,利用Nano UHPLC-MS/MS质谱技术对玉米早期发育的花药在蛋白质组和磷酸化蛋白质组水平进行全面分析,以探究玉米花药发育过程中的蛋白调控网络和磷酸化修饰调控网络。在蛋白质组学分析中,共鉴定到了3 016个多肽,匹配到1 032个蛋白质上。通过Map Man分析,预测到了一些和花药发育相关的蛋白质,例如受体激酶(GRMZM2G082823_P01、GRMZM5G805485_P01等)。另外,在磷酸化蛋白质组学研究中,通过对Ti O2亲和层析富集到的磷酸化多肽进行质谱分析,检测到了257个磷酸化多肽,匹配到210个蛋白质上。我们的数据揭示了玉米花药发育过程中的223个磷酸化位点。与已发现的玉米中的86个磷酸化蛋白质(植物蛋白磷酸化数据库(P3DB):http://www.p3db.org/organism.php)相比,其中203个磷酸化蛋白和218个磷酸化位点为首次揭示。进一步生物信息学分析表明:磷酸化在14-3-3蛋白质、激酶、磷酸酶、转录因子、细胞周期和染色质结构相关的蛋白质介导的玉米早期花药发育过程中起着重要的调控作用。总之,本研究首次在蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学水平研究了玉米早期花药发育的蛋白质调控网络,不仅丰富了玉米蛋白质和磷酸化修饰蛋白质数据库,并为利用遗传学和生物化学手段深入研究玉米花药发育的分子调控机理提供了基础。

关 键 词:玉米花药,蛋白质组,磷酸化,激酶,调控网络
收稿时间:2015/10/23 0:00:00

Global proteomic and phosphoproteomic analysis of the premature maize anther
Zhimin Zhang,Juanying Ye,Haifei Long,Yue Hong and Pingli Lu.Global proteomic and phosphoproteomic analysis of the premature maize anther[J].Chinese Journal of Biotechnology,2016,32(7):937-955.
Authors:Zhimin Zhang  Juanying Ye  Haifei Long  Yue Hong and Pingli Lu
Institution:Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China,Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China,Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China,Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China and Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China
Abstract:
Keywords:maize anther  proteome  phosphorylation  kinase  regulatory network
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