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大豆GolS基因家族鉴定及盐旱胁迫下的表达分析
引用本文:刘丹,王柯蔼,倪蓬,王秋艳,朱康,危文亮.大豆GolS基因家族鉴定及盐旱胁迫下的表达分析[J].生物工程学报,2022,38(10):3757-3772.
作者姓名:刘丹  王柯蔼  倪蓬  王秋艳  朱康  危文亮
作者单位:长江大学 农学院, 湖北 荆州 434025
基金项目:国家自然科学基金(31871661)
摘    要:肌醇半乳糖苷合成酶(galactinol synthase,GolS)是棉子糖家族寡糖(raffinose family oligosaccharides,RFOs)生物合成途径中的关键酶,在植物对非生物胁迫的反应中发挥重要作用。然而,关于大豆(Glycine maxGolS基因家族成员的分子结构特征还未见研究报道。本研究在全基因组水平上鉴定了6个大豆GolS基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、进化关系、基因结构、保守基序、二级结构、三级结构、组织特异性表达模式以及盐和干旱胁迫下的表达量进行了分析。结果表明:6个大豆GolS基因不均匀地分布在4条染色体上,6个大豆GolS蛋白的等电点为5.45-6.08,分子量变化范围为37 567.07-38 817.59 Da,氨基酸数量为324-339 aa;亚细胞定位预测结果发现4个蛋白定位在叶绿体上,2个蛋白定位在细胞质。系统进化树分析表明,大豆GolS基因家族成员在进化树中呈现出两两紧邻的现象,在进化上较为保守。6个基因成员含有的外显子数目为3或4。二级结构和三级结构预测表明,该家族所有成员蛋白质的空间结构主要由α螺旋和无规则卷曲结构组成,有较少的β转角结构和延伸链结构。组织特异性表达分析表明,6个GmGolS家族成员在种子、根、根毛、花、茎、豆荚、根瘤和叶中均有不同程度表达。基于qRT-PCR的表达分析显示,盐旱处理后所有GmGolS基因成员表现出不同程度的上调表达,表明这些基因可能与植物的耐盐抗旱响应有关。本研究结果为后续开展大豆GolS基因的功能解析奠定了基础。

关 键 词:大豆  GolS基因家族  进化分析  干旱胁迫  盐胁迫  表达模式
收稿时间:2022/6/7 0:00:00

Identification of soybean GolS gene family and analysis of expression patterns under salt and drought stresses
LIU Dan,WANG Keai,NI Peng,WANG Qiuyan,ZHU Kang,WEI Wenliang.Identification of soybean GolS gene family and analysis of expression patterns under salt and drought stresses[J].Chinese Journal of Biotechnology,2022,38(10):3757-3772.
Authors:LIU Dan  WANG Keai  NI Peng  WANG Qiuyan  ZHU Kang  WEI Wenliang
Institution:College of Agriculture, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China
Abstract:
Keywords:soybean  GolS gene family  evolutionary analysis  drought stress  salt stress  expression pattern
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