| 基于转录组测序的Cd胁迫下芹菜细胞自噬相关基因的筛选 |
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| 引用本文： | 肖旭峰,李猛,司舒成,范淑英,吴才君,张明.基于转录组测序的Cd胁迫下芹菜细胞自噬相关基因的筛选[J].生物工程学报,2020,36(8):1610-1619. |
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| 作者姓名： | 肖旭峰 李猛 司舒成 范淑英 吴才君 张明 |
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| 作者单位： | 1 江西农业大学 农学院，江西 南昌 330045;2 江西生物科技职业学院，江西 南昌 330200 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 (No. 31860560)，江西农业大学博士启动基金 (No. 3181) 资助。 |
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| 摘 要： | 细胞自噬是植物逆境应答过程中最常见的保护机制之一。动物中,自噬相关基因抵御镉(Cd)毒害的功能研究较清楚,但植物却知之甚少。文中以芹菜品种‘皇后’为试材,采用外源Cd(终浓度为0、2、4、8mg/L)添加营养液水培处理,利用转录组测序(RNA-seq)技术筛选细胞自噬相关差异基因并进行q RT-PCR验证。结果表明Cd胁迫对芹菜植株产生了明显的毒害作用,并与浓度间产生了量效关系。在筛选的8个差异表达的自噬相关基因中,ATG8a、ATG8f、ATG13、AMPK-1、AMPK-2基因随Cd浓度升高表达上调,ATG12、VPS30和VPS34则先上调后下降,说明自噬相关基因可能通过表达上调增加了自噬小体结构以抵御Cd毒性作用;而高浓度Cd(8mg/L)可能超出芹菜的耐受范围,导致多个自噬基因又出现表达下调趋势。以上结果有助于后期自噬相关基因的功能研究,为进一步探讨芹菜对Cd胁迫的耐性机制提供参考依据。
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| 关 键 词： | Cd胁迫，芹菜，转录组，自噬相关基因，筛选 |
| 收稿时间： | 2019/12/3 0:00:00 |
Effect of Cd on autophagy-related genes of celery |
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| Xufeng Xiao,Meng Li,Shucheng Si,Shuying Fan,Caijun Wu,Ming Zhang.Effect of Cd on autophagy-related genes of celery[J].Chinese Journal of Biotechnology,2020,36(8):1610-1619. |
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| Authors: | Xufeng Xiao Meng Li Shucheng Si Shuying Fan Caijun Wu Ming Zhang |
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| Institution: | 1 College of Agronomy, Jiangxi Agricultural University, Nanchang 330045, Jiangxi, China; 2 Jiangxi Biotech Vocational College, Nanchang 330200, Jiangxi, China |
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