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镉胁迫后旱柳转录组变化分析
引用本文:曹继敏,李双财,何德.镉胁迫后旱柳转录组变化分析[J].生物工程学报,2020,36(7):1365-1377.
作者姓名:曹继敏  李双财  何德
作者单位:西南林业大学 生命科学学院,云南 昆明 650224
基金项目:国家自然科学基金 (No. 31260041),云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目 (No. 50097505),云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新 (No. 51400605) 资助。
摘    要:随着重金属镉(Cd)应用范围的扩大,由此引发的土壤镉污染问题日益严重。以具有植物恢复潜力的旱柳Salix matsudana作为研究对象,探究不同浓度的Cd (2.5 mg/L, 50 mg/L)胁迫后旱柳无性系1 d、7 d和30 d后基因表达与代谢通路的变化。转录组测序结果表明:共获得102 595个非冗余基因(Unigenes),相同浓度不同时间的差异基因总数为26 623个和32 154个;相同时间不同浓度的差异基因总数为8 550个、3 444个和11 428个。从中筛选得到与Cd胁迫响应密切相关的基因25个,其中金属硫蛋白、ABC转运蛋白、锌和锰转运蛋白等基因的表达不仅会随着Cd胁迫浓度变化而且同时受到胁迫时间的改变而发生改变;油菜素内酯合成通路的ROT3和黄酮类化合物合成通路的FLS、F3H均明显上调。此外Cd胁迫引起旱柳在代谢过程、细胞过程、膜、细胞器、细胞、细胞部分、催化活化和结合蛋白这8个方面发生改变,参与这些GO条目的差异表达基因数随着Cd浓度和胁迫时间的增加而增加。并对转录组信息的可靠性用RT-PCR和酶活性生理实验数据进行了验证。文中通过转录组测序分析旱柳Cd胁迫后的响应机制,从而为旱柳修复土壤Cd污染提供理论指导。

关 键 词:旱柳,镉,转录组,差异表达基因
收稿时间:2019/10/30 0:00:00
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