| 基于深度学习的蛋白质建模与设计 |
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| 引用本文： | 夏彬彬,王军.基于深度学习的蛋白质建模与设计[J].生物工程学报,2021,37(11):3863-3879. |
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| 作者姓名： | 夏彬彬 王军 |
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| 作者单位： | 1 中国科学院微生物研究所 中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室，北京 100101;2 中国科学院大学，北京 100049 |
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| 基金项目： | 国家重点研究发展计划 (No. 2018YFC2000500)，中国科学院战略重点研究计划 (No. XDB29020000)，国家自然科学基金 (Nos. 31771481，91857101) 资助。 |
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| 摘 要： | 随着蛋白质序列及结构数据的大量累积，在获得了大量描述性信息之后如何有效利用海量数据，从已有数据中高效提取信息并且应用到下游任务当中就成为了研究者亟待解决的问题。蛋白质的设计可使新蛋白的研发不再受限于实验条件，这对药物靶点预测、新药研发和材料设计等领域具有重要意义。深度学习作为一种高效的数据特征提取方法，可以通过它对蛋白质数据进行建模，进而加入先验信息对蛋白质进行设计。故此基于深度学习的蛋白质设计就成为一个具有广阔前景的研究领域。文中主要阐述基于深度学习的蛋白质序列与结构数据的建模和设计方法。详述该方法的策略、原理、适用范围、应用实例。讨论了深度学习方法在本领域的应用前景及局限性，以期为相关研究提供参考。
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| 关 键 词： | 蛋白质设计，结构预测，蛋白质数据建模，深度学习，结构生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021/5/27 0:00:00 |
Protein modeling and design based on deep learning |
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| Binbin Xi,Jun Wang.Protein modeling and design based on deep learning[J].Chinese Journal of Biotechnology,2021,37(11):3863-3879. |
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| Authors: | Binbin Xi Jun Wang |
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| Institution: | 1 CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;2 University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein design structure prediction protein data modeling deep learning structural bioinformatics |
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