| 新疆艾比湖沉积物中免培养放线菌的多样性北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 吕杰,吕光辉,马媛.新疆艾比湖沉积物中免培养放线菌的多样性北大核心CSCD[J].微生物学报,2016,56(9):1426-1433. |
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| 作者姓名： | 吕杰 吕光辉 马媛 |
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| 作者单位： | 新疆大学资源与环境科学学院, 新疆 乌鲁木齐 830046;绿洲生态重点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830046,新疆大学资源与环境科学学院, 新疆 乌鲁木齐 830046;绿洲生态重点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830046,新疆大学资源与环境科学学院, 新疆 乌鲁木齐 830046;绿洲生态重点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830046 |
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| 基金项目： | 新疆自然科学基金（2011211B11）；绿洲生态自治区重点实验室开放课题（XJDX0206-2011-03） |
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| 摘 要： | 【目的】采用免培养的方法研究新疆艾比湖湖底沉积物放线菌组成及多样性。【方法】采集并混合5份艾比湖湖底沉积物样本,并提取其总DNA,采用放线菌通用引物对其16S r RNA基因序列进行Touchdown PCR,构建放线菌16S r RNA基因文库。蓝白斑筛选后随机挑选白色克隆分析,利用限制性内切酶HhaⅠ进行酶切分型,挑选具有独特限制性片段差异的阳性克隆进行测序分析。序列经Chimera Check检测,BLAST同源比对及构建16S r RNA基因序列系统发育树。【结果】随机挑选192个白色克隆,其中166个为阳性克隆,选取51个具有独特限制性片段差异的克隆进行序列分析。测序结果进行比对以及Chimera Check检测后,共获得36个可操作单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),Gen Bank注册号为KR182090-KR182131。文库覆盖度结果表明克隆文库涵盖了本环境中90.4%的放线菌类群。聚类结果显示,艾比湖湖底沉积物中放线菌分为2个类群,第1个类群属于放线菌门(Actinobacteria),放线菌纲(Actinobacteria)中的放线菌目(Actinomycetales)、丙酸杆菌目(Propionibacteriales)、微球菌目(Micrococcales)和棒杆菌目(Corynebacteriales)4个目,该类群占克隆文库18.1%;另外1个类群属于Unclassified Actinobacteria的类群,分为3个不同的group,占整个克隆文库的81.9%。【结论】新疆艾比湖湖底沉积物中存在多种未知的放线菌类群。
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| 关 键 词： | 盐湖 艾比湖 放线菌 多样性 |
| 收稿时间： | 2015/11/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/3/19 0:00:00 |
Actinobacterial diversity in sediments of Ebinur lake, Xinjiang, China |
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| Jie Lv,Guanghui Lv and Yuan Ma.Actinobacterial diversity in sediments of Ebinur lake, Xinjiang, China[J].Acta Microbiologica Sinica,2016,56(9):1426-1433. |
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| Authors: | Jie Lv Guanghui Lv and Yuan Ma |
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| Institution: | College of Resource and Environment Sciences, Xinjiang University, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;Xinjiang Key Laboratory of Oasis Ecology, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China,College of Resource and Environment Sciences, Xinjiang University, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;Xinjiang Key Laboratory of Oasis Ecology, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China and College of Resource and Environment Sciences, Xinjiang University, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;Xinjiang Key Laboratory of Oasis Ecology, Urumqi 830046, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | salt lake Ebinur lake actinobacteria diversity |
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