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园林植物女贞不同生态位细菌群落结构及其多样性
引用本文:李斌,史鸿翔,刘兰兰,张欣,杨璞,陈航,冯颖,陈晓鸣.园林植物女贞不同生态位细菌群落结构及其多样性[J].微生物学报,2022,62(2):686-702.
作者姓名:李斌  史鸿翔  刘兰兰  张欣  杨璞  陈航  冯颖  陈晓鸣
作者单位:中国林业科学研究院资源昆虫研究所, 国家林业和草原局资源昆虫培育与利用重点实验室, 云南 昆明 650224;南京林业大学林学院, 江苏 南京 210037;西南林业大学生物多样性保护学院, 云南 昆明 650224
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFYBB2019SZ005,CAFYBB2017ZB005)
摘    要:【目的】女贞是我国分布广泛的园林绿化树种、药用植物和资源昆虫白蜡虫的优良寄主植物,解析女贞叶、茎、根、根际土壤4种生态位的细菌群落结构、物种组成和多样性特征,为研究女贞及其相关微生物组的互作及开发利用女贞内生和根际细菌资源奠定基础。【方法】以女贞叶、茎、根、根际土壤为研究材料,基于细菌16S rRNA基因V5–V7区,通过Illumina MiSeq扩增子高通量测序和生物信息学分析,比较女贞不同生态位细菌群落结构、物种组成、功能的差异性和相似性。【结果】女贞4种样本共获得168229条有效序列,聚类后共计977个OTU,归属于23门,54纲,138目,227科和399属。不同生态位细菌群落多样性从根际土壤到根、茎、叶自下而上逐渐降低,Shannon指数分别为4.514、3.856、2.704和1.908。β-多样性分析表明,女贞4种生态位细菌群落结构存在显著差异(R=0.8426,P<0.05),而叶与茎(R=0.4815,P>0.05)、根与根际土壤(R=0.8889,P>0.05)的细菌群落结构相对较为相似。在物种组成上,根、茎和叶内生细菌群落中相对丰度较高的为变...

关 键 词:女贞  植物内生细菌  根际细菌  群落结构  多样性  生态位分化  功能预测
收稿时间:2021/5/26 0:00:00
修稿时间:2021/9/4 0:00:00

Structure and diversity of bacterial community in different niches of garden plant Ligustrum lucidum Ait.
LI Bin,SHI Hongxiang,LIU Lanlan,ZHANG Xin,YANG Pu,CHEN Hang,FENG Ying,CHEN Xiaoming.Structure and diversity of bacterial community in different niches of garden plant Ligustrum lucidum Ait.[J].Acta Microbiologica Sinica,2022,62(2):686-702.
Authors:LI Bin  SHI Hongxiang  LIU Lanlan  ZHANG Xin  YANG Pu  CHEN Hang  FENG Ying  CHEN Xiaoming
Institution:Key Laboratory of Cultivating and Utilization of Resources Insects of National Forestry and Grassland Administration, Research Institute of Resources Insects, Chinese Academy of Forestry, Kunming 650224, Yunnan, China;College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, Jiangsu, China;College of Biodiversity Conservation and Utilization, Southwest Forestry University, Kunming 650224, Yunnan, China
Abstract:
Keywords:Ligustrum lucidum Ait    endophytic bacteria  rhizospheric bacteria  community structure  diversity  niche differentiation  function prediction
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