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外源酚酸诱导枳菌根共生相关基因筛选
引用本文:王明元,李建福,刘建福,徐志周,林萍,李雨晴.外源酚酸诱导枳菌根共生相关基因筛选[J].微生物学报,2019,59(7):1383-1394.
作者姓名:王明元  李建福  刘建福  徐志周  林萍  李雨晴
作者单位:华侨大学园艺系, 福建 厦门 361021,上海交通大学农业与生物学院, 上海 200240,华侨大学园艺系, 福建 厦门 361021,华侨大学园艺系, 福建 厦门 361021,华侨大学园艺系, 福建 厦门 361021,华侨大学园艺系, 福建 厦门 361021
基金项目:国家自然科学基金(31101512);福建省科技厅高校产学研重大项目(2017N5009)
摘    要:【目的】基于丛枝菌根(AM)真菌改变柑橘酚类现象,筛选外源酚酸诱导菌根共生差异基因,分析酚相关基因功能。【方法】以枳(Poncirus trifoliate L.)接种AM真菌,并施加外源酚酸,采用随机引物扩增,获得差异表达片段;继而克隆酚相关基因并进行生物信息学分析。【结果】试验采用20条随机引物和3条锚定引物扩增cDNA,共获得了154条差异显示的表达片段;对其中16条Northern杂交显示阳性的片段测序与比对,发现9条有相关功能注释,参与环境因子及内源信号的识别,调节共生体的形成;DD-11基因只有在外源酚酸添加和接种AM真菌的根系中表达,该片段cDNA全长序列长度为1382 bp,编码454个氨基酸,分子式为C_(2210)H_(3427)N_(603)O_(657)S_(31),其理论等电点和相对分子量分别为7.81和49950.03;磷酸化分析发现,该蛋白有22个丝氨酸残基、14个苏氨酸残基及7个酪氨酸残基可能成为蛋白激酶磷酸化位点。通过PredictProtein服务器对DD-11蛋白质的二级结构进行分析,该蛋白含有α螺旋22%、无规则卷曲58%、延伸链20%,不含有β折叠结构。【结论】本试验获得菌根共生过程酚相关基因,其功能与植物内源信号识别密切相关,为探讨酚类在菌根共生过程中的分子机制提供了新的视角。

关 键 词:丛枝菌根真菌  酚酸  差异片段筛选  蛋白结构
收稿时间:2018/11/13 0:00:00
修稿时间:2019/1/3 0:00:00

Screening of genes induced by exogenous phenolic on mycorrhized Poncirus trifoliate
Mingyuan Wang,Jianfu Li,Jianfu Liu,Zhizhou Xu,Ping Lin and Yuqing Li.Screening of genes induced by exogenous phenolic on mycorrhized Poncirus trifoliate[J].Acta Microbiologica Sinica,2019,59(7):1383-1394.
Authors:Mingyuan Wang  Jianfu Li  Jianfu Liu  Zhizhou Xu  Ping Lin and Yuqing Li
Institution:Horticultural Department, Huaqiao University, Xiamen 361021, Fujian Province, China,School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China,Horticultural Department, Huaqiao University, Xiamen 361021, Fujian Province, China,Horticultural Department, Huaqiao University, Xiamen 361021, Fujian Province, China,Horticultural Department, Huaqiao University, Xiamen 361021, Fujian Province, China and Horticultural Department, Huaqiao University, Xiamen 361021, Fujian Province, China
Abstract:
Keywords:arbuscular mycorrhizal fungi  phenolic acid  screening of differential fractions  protein struction
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