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| 牦牛瘤胃元基因组文库中木聚糖酶基因的分析 | |
| 引用本文： | 王敏,陈富荣,张山,朱雅新,东秀珠,黄力,田瑞华,董志扬,戴欣.牦牛瘤胃元基因组文库中木聚糖酶基因的分析[J].微生物学报,2011,51(10):1364-1373. |
| 作者姓名： | 王敏 陈富荣 张山 朱雅新 东秀珠 黄力 田瑞华 董志扬 戴欣 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院微生物研究所,微生物资源前期开发国家重点实验室,北京 100101;内蒙古农业大学生命科学学院,呼和浩特010018 2. 中国科学院微生物研究所,微生物资源前期开发国家重点实验室,北京 100101;内蒙古工业大学化工学院,呼和浩特010051 3. 中国科学院微生物研究所,微生物资源前期开发国家重点实验室,北京 100101 4. 内蒙古农业大学生命科学学院,呼和浩特,010018 |
| 基金项目： | 国家“973 项目”(2011CB100800);中国科学院重大项目(KSCX1-YW-11B1);国家自然科学基金(30770053) |
| 摘 要： | 【目的】了解牦牛瘤胃微生物木聚糖酶多样性及其降解特征,为木聚糖降解提供新的基因资源。【方法】根据对已构建的瘤胃微生物元基因组细菌人工染色体(BAC)克隆文库高通量测序结果的注释,筛选其中编码木聚糖酶的基因并进行多样性分析;对其中一个木聚糖酶基因及其连锁的木糖苷酶基因进行克隆表达和酶学性质表征,分析其协同作用。【结果】共筛选到14个木聚糖酶基因,均编码GH10家族木聚糖酶,其氨基酸序列之间的相似性为20.5%-91.3%;其中7个木聚糖酶基因所在的不同的DNA片段(contig)上存在木糖苷酶基因,编码的木糖苷酶属于GH43或GH3糖苷水解酶家族。将其中一对连锁的木聚糖酶(Xyn32)和木糖苷酶基因(Xyl33)分别克隆、表达和纯化。纯化后的木聚糖酶比活为1.98 IU/mg,但不具有阿魏酸酯酶活性;木糖苷酶比活为0.07 U/mg,且具有α-阿拉伯呋喃糖苷酶活性。体外实验证明,木糖苷酶Xyl33对与之连锁的木聚糖酶Xyn32的木聚糖降解具有协同作用。 |
| 关 键 词： | 牦牛瘤胃 细菌人工染色体(BAC)文库 木聚糖酶 木糖苷酶 协同作用 |
| 收稿时间： | 2011/3/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 6/7/2011 12:00:00 AM |
Analysis of xylanases derived from the metagenomic BAC clone library of yak rumen |
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| Min Wang,Furong Chen,Shan Zhang,Yaxin Zhu,Xiuzhu Dong,Li Huang,Ruihua Tian,Zhiyang Dong and Xin Dai.Analysis of xylanases derived from the metagenomic BAC clone library of yak rumen[J].Acta Microbiologica Sinica,2011,51(10):1364-1373. | |
| Authors: | Min Wang Furong Chen Shan Zhang Yaxin Zhu Xiuzhu Dong Li Huang Ruihua Tian Zhiyang Dong and Xin Dai |
| Institution: | Min Wang1,2,Furong Chen1,3,Shan Zhang1,Yaxin Zhu1,Xiuzhu Dong1,Li Huang1,Ruihua Tian2,Zhiyang Dong1,Xin Dai1 1 State Key Laboratory of Microbial Resource,the Institute of Microbiology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China 2 College of Life Sciences,Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010018,China 3 College of Chemical Engineering,Inner Mongolia University of Technology,Huhhot 010051,China |
| Abstract: | Objective] The diversity of rumen microbial xylanases and their degradation characteristics were studied and the resources of new xylanases genes and enzymes were provided.Methods] According to the result of the high-throughput sequencing of the rumen microbial metagenome bacterial artificial chromosome(BAC) clones library,the diversity of xylanase genes was analyzed and screened.Then one xylanase and its downstream xylosidase gene screened was cloned and expressed in Escherichia coli.The enzyme character... |
| Keywords: | yak rumen bacterial artificial chromosome(BAC) clone library xylanase xylosidase synergistic effect |
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