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溶藻弧菌中类霍乱弧菌毒力岛转座酶基因及侧翼序列分子生物学特征分析
引用本文:罗鹏,胡超群.溶藻弧菌中类霍乱弧菌毒力岛转座酶基因及侧翼序列分子生物学特征分析[J].微生物学报,2008,48(10):1367-1372.
作者姓名:罗鹏  胡超群
作者单位:中国科学院南海海洋研究所,中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广州,510301
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划),国家自然科学基金
摘    要:目的]调查类似霍乱弧菌毒力岛(VPI)转座酶(vpiT)的基因是否在溶藻弧菌中分布,并了解其全序列及侧翼序列的分子生物学特征.方法]对94株溶藻弧菌是否携带类似VPI的vpiT基因进行PCR检测,对阳性株进行了PCR产物直接测序,根据获得的部分已知序列,设计引物,通过反向PCR扩增出全长类似vpiT的基因valT及部分侧翼片段,对反向PCR产物进行克隆测序,然后对获得的valT及侧翼序列进行生物信息学分析.结果]发现94株溶藻弧菌中只有从粤东对虾池水分离的2个株E06011、E0612在PCR检测中产生了预期扩增片段.测序表明两者序列(valT-S1)完全一致.根据反向PCR及克隆最终获得的溶藻弧菌E0601全长valT基因及部分侧翼序列valT-S3.对valT-S3生物信息学分析表明:valT是一个高度类似于霍乱弧菌毒力岛vpiT的转座酶基因.结论]根据上述结果及相关文献,有理由相信valT基因及其侧翼片段是异源获得,霍乱弧菌VPI元件或整体很可能在包括溶藻弧菌在内的弧菌种间转移.

关 键 词:溶藻弧菌  霍乱弧菌  毒力岛  转座酶
收稿时间:2008/3/15 0:00:00

Analysis of molecular biological characteristic of the gene and its flanking sequences, similar with transposase in Vibrio cholerae pathogenicity island, among V. alginolyticus strains
Peng Luo and Chaoqun Hu.Analysis of molecular biological characteristic of the gene and its flanking sequences, similar with transposase in Vibrio cholerae pathogenicity island, among V. alginolyticus strains[J].Acta Microbiologica Sinica,2008,48(10):1367-1372.
Authors:Peng Luo and Chaoqun Hu
Institution:South China Sea Institute of Oceanology, Key Laboratory of Marine Bio-resources Sustainable Utilization, CAS, Guangzhou 510301, China;South China Sea Institute of Oceanology, Key Laboratory of Marine Bio-resources Sustainable Utilization, CAS, Guangzhou 510301, China
Abstract:
Keywords:Vibrio alginolyticus  Vibrio cholerae  pathogenicity island  transposase
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