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三七连作根际土壤微生物区系的16S rRNA系统遗传多样性
引用本文:陆晓菊,官会林,张正芸,马永存,唐蜀昆.三七连作根际土壤微生物区系的16S rRNA系统遗传多样性[J].微生物学报,2015,55(2):205-213.
作者姓名:陆晓菊  官会林  张正芸  马永存  唐蜀昆
作者单位:云南师范大学能源与环境科学学院,云南昆明650092,云南师范大学能源与环境科学学院,云南昆明650092,云南师范大学能源与环境科学学院,云南昆明650092,云南大学云南省微生物研究所,云南昆明650091,云南大学云南省微生物研究所,云南昆明650091
基金项目:国家自然科学基金项目(41361075);云南省应用基础研究重点项目(2013FA015);云南省教育厅科学研究基金重大专项项目(ZD2013008)
摘    要:【目的】针对三七连作土传病害的生物防治技术研究,探讨其根际土壤微生物多样性与根腐病害的关联性。【方法】采集三七连作6年的健康植株与根腐病植株根际土壤,采用多种培养基进行分离、纯化,并对分离菌株提取DNA,用其16S rRNA序列的通用引物进行PCR扩增,进行Blast同源及其系统进化树分析。【结果】从采集样品中分离出的菌株分布于细菌域(Bacteria)中的4个门(Phyla)共40个属(Genera),其中从健康植株组土壤中培养出179株菌,分布于30个属,以伯克氏菌属(Burkholderia)、节杆菌属(Arthrobacter)、链霉菌属(Streptomyces)及芽孢杆菌属(Bacillus)为优势菌群;根腐病株组土样共培养出117株菌,分布于29个属,以罗尔斯顿菌属(Ralstonia——病原菌)、单胞菌属(Sphingomonas)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)等为优势菌群;其中黄杆菌属(Flavobacterium)、肠杆菌属(Enterobacter)的分离菌株仅从病株组土壤中分离到;发现其可能新种5株;健康组与根腐病组土壤EC值及各元素离子浓度差异明显(P<0.05),健康组土壤中的优势微生物种群分布与土样中的EC值、NO-3、SO2-4、CO2-3、K+及全盐量呈负相关关系(显著度P<0.01)。【结论】研究表明,诱导三七连作土传病害的发生,除病原菌作用影响外,还与土壤理化性质和土壤微生物的种群结构及其优势微生物的种群比例具有密切的关联性,特别是土壤中有益微生物(Burkholderia,Bacillus,Streptomyces等)的丰度,对评价三七土壤健康状况及病害防治预报具有重要的指导意义。

关 键 词:三七  根腐病害  土壤微生物  多样性分析  土壤理化性质
收稿时间:6/5/2014 12:00:00 AM
修稿时间:2014/10/13 0:00:00

Microbial distribution and 16S rRNA diversity in the rhizosphere soil of Panax notoginseng
Xiaoju Lu,Huilin Guan,Zhengyun Zhang,Yongcun Ma and Shukun Tang.Microbial distribution and 16S rRNA diversity in the rhizosphere soil of Panax notoginseng[J].Acta Microbiologica Sinica,2015,55(2):205-213.
Authors:Xiaoju Lu  Huilin Guan  Zhengyun Zhang  Yongcun Ma and Shukun Tang
Institution:Xiaoju Lu;Huilin Guan;Zhengyun Zhang;Yongcun Ma;Shukun Tang;Energy and Environment Science College,Yunnan Normal University;Yunnan Institute of Microbiology,Yunnan University;
Abstract:
Keywords:Panax notoginseng  root rot  soil microbes  diversity analysis  physical-chemical characteristics of soil
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