| 副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和芯片质量的评价 |
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| 引用本文： | 韩海红,曾小涛,殷胜骏,杨瑞馥,周冬生,刘秀梅.副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和芯片质量的评价[J].微生物学报,2010,50(4):548-553. |
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| 作者姓名： | 韩海红 曾小涛 殷胜骏 杨瑞馥 周冬生 刘秀梅 |
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| 作者单位： | 中国疾病预防控制中心营养与食品安全所，北京，100021;军事医学科学院微生物流行病研究所，北京，100071;军事医学科学院微生物流行病研究所，北京，100071;军事医学科学院微生物流行病研究所，北京，100071;军事医学科学院微生物流行病研究所，北京，100071;中国疾病预防控制中心营养与食品安全所，北京，100021 |
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| 基金项目： | “十一五”国家科技支撑计划（2006BAK02A15）；国家自然科学基金（30871370）；国家科技重大专项（2008ZX10004-103） |
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| 摘 要： | 摘要 目的 研制副溶血性弧菌全基因组芯片，建立芯片杂交方法，并对芯片质量进行评价。方法 利用副溶血性弧菌全基因组序列，挑选出4770条基因，PCR扩增各基因并将PCR产物纯化，点样制备芯片；设计了两个质控杂交组合，采用双色荧光杂交策略，对芯片质量进行评价；PCR方法验证部分芯片结果。结果 芯片杂交与理论预期结果以及PCR验证结果完全一致。结论 成功的研制了一批质量良好的副溶血性弧菌全基因组DNA芯片，并建立了基于DNA芯片的副溶血性弧菌比较基因组学技术平台，建立了一套系统的芯片数据分析的标准方法。
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| 关 键 词： | 关键词 副溶血性弧菌 DNA芯片 比较基因组学 进化基因组学 功能基因组学 |
| 收稿时间： | 2009/12/5 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/1/20 0:00:00 |
Development of whole-genome DNA microarray of Vibrio parahaemolyticus and evaluation of the microarray quality |
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| Haihong Han,Xiaotao Zeng,Shengjun Yin,Ruifu Yang,Dongsheng Zhou and Xiumei Liu.Development of whole-genome DNA microarray of Vibrio parahaemolyticus and evaluation of the microarray quality[J].Acta Microbiologica Sinica,2010,50(4):548-553. |
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| Authors: | Haihong Han Xiaotao Zeng Shengjun Yin Ruifu Yang Dongsheng Zhou and Xiumei Liu |
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| Institution: | Institute of Nutrition and Food Safety, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100021, China;State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China;State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China;State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China;State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China;Institute of Nutrition and Food Safety, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Keywords Vibrio parahaemolyticus DNA microarray comparative genomics evolutionary genomics functional genomics |
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