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CRISPR/Cas9介导的USP30基因敲除细胞系的建立及其对塞内卡病毒增殖的影响
引用本文:赵振翔,张向乐,杨帆,曹伟军,顾峰幸,李康丽,郑海学,王雯慧,朱紫祥.CRISPR/Cas9介导的USP30基因敲除细胞系的建立及其对塞内卡病毒增殖的影响[J].微生物学报,2023,63(10):4064-4074.
作者姓名:赵振翔  张向乐  杨帆  曹伟军  顾峰幸  李康丽  郑海学  王雯慧  朱紫祥
作者单位:甘肃农业大学动物医学院, 甘肃 兰州 730070;中国农业科学院兰州兽医研究所 兰州大学动物医学与生物安全学院 动物疫病防控全国重点实验室, 甘肃 兰州 730046
基金项目:国家重点研发计划(2021YFD1800300);甘肃省重大专项(21ZD3NA001,20ZD7NA006,19ZDNA001);“十四五”广东省农业科技创新十大主攻方向“揭榜挂帅”项目(2022SDZG02);生猪产业体系(CARS-35);甘肃省优秀博士生项目(23JRRA559);兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky-2022-13)
摘    要:【目的】利用规律成簇的间隔短回文重复序列/Cas9核酸酶(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Cas9 nuclease,CRISPR/Cas9)技术建立USP30基因敲除的人胚胎肾细胞(human embryonic kidney 293T cells,HEK-293T)细胞系,为开展宿主泛素特异性蛋白酶30(ubiquitin-specific protease 30,USP30)蛋白的功能研究建立了细胞模型;同时,初步探究USP30蛋白在病毒感染过程中的作用。【方法】根据Ensemble数据库查询USP30基因序列,定位USP30在基因组中不同转录本重叠区的第一个外显子段,设计并合成2对引导RNA (single guide RNAs,sgRNA),分别构建在pX459载体中;将pX459-USP30-sgRNA质粒转染HEK-293T细胞,并用嘌呤霉素处理,筛选出转染阳性的细胞,然后通过有限稀释法筛选单克隆细胞,通过Western blotting及测序检测USP30基因的敲除。通过Western blotting及实时荧光定量PCR分析比较塞内卡病毒(Senecavirus A,SVA)在野生型和USP30基因敲除HEK-293T细胞中的复制差异。【结果】Western blotting及测序证实USP30基因敲除单克隆细胞系构建成功。进一步实验发现,SVA在USP30基因敲除细胞中的复制水平显著低于野生型细胞。【结论】成功构建USP30基因敲除的HEK-293T细胞系,首次证明USP30对SVA的复制具有促进作用,为进一步揭示USP30相关免疫反应和SVA感染过程的作用机制提供了良好的细胞模型,也为开展宿主USP30蛋白调控病毒复制的机制研究提供了关键工具和一定的理论依据。

关 键 词:CRISPR/Cas9  泛素特异性蛋白酶30  基因敲除细胞  塞内卡病毒
收稿时间:2023/2/20 0:00:00
修稿时间:2023/5/12 0:00:00

HEK-293T cells with USP30 knockout: construction using the CRISPR/Cas9 system and effects on Senecavirus A replication
ZHAO Zhenxiang,ZHANG Xiangle,YANG Fan,CAO Weijun,GU Fengxing,LI Kangli,ZHENG Haixue,WANG Wenhui,ZHU Zixiang.HEK-293T cells with USP30 knockout: construction using the CRISPR/Cas9 system and effects on Senecavirus A replication[J].Acta Microbiologica Sinica,2023,63(10):4064-4074.
Authors:ZHAO Zhenxiang  ZHANG Xiangle  YANG Fan  CAO Weijun  GU Fengxing  LI Kangli  ZHENG Haixue  WANG Wenhui  ZHU Zixiang
Institution:College of Veterinary Medicine, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, Gansu, China;State Key Laboratory for Animal Disease Control and Prevention, College of Veterinary Medicine, Lanzhou University, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou 730046, Gansu, China
Abstract:
Keywords:CRISPR/Cas9  ubiquitin-specific protease 30  cells with gene knockout  Senecavirus A
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