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干湿交替水分胁迫对水稻土细菌群落影响的研究
引用本文:周晓丽,包丽君,柳旭,熊艺,褚海燕,贾仲君.干湿交替水分胁迫对水稻土细菌群落影响的研究[J].微生物学报,2022,62(3):1004-1019.
作者姓名:周晓丽  包丽君  柳旭  熊艺  褚海燕  贾仲君
作者单位:盐城师范学院海洋与生物工程学院, 江苏 盐城 224007;中国科学院南京土壤研究所, 土壤与农业可持续发展国家重点实验室, 江苏 南京 210008;北京大学深圳研究生院环境与能源学院, 广东 深圳 518055;中国科学院南京土壤研究所, 土壤与农业可持续发展国家重点实验室, 江苏 南京 210008;中国科学院大学, 北京 100049
基金项目:国家自然科学基金(41530857,91751204)
摘    要:【目的】连续3次风干-湿润循环培养水稻土,在DNA和RNA水平下,探究细菌对干湿交替胁迫的响应机制,明确风干水稻土能否代替新鲜土壤进行细菌群落组成分析。【方法】针对我国江苏省常熟市水稻土,开展新鲜土壤的3次风干-湿润循环连续培养处理(每次循环中风干、湿润状态各维持7 d),在DNA和RNA水平应用16S rRNA基因高通量测序和实时荧光定量PCR技术,分析细菌数量和群落组成的变化规律。【结果】在湿润-风干过程中,DNA水平细菌数量降幅高达300–771倍,但RNA水平仅为1.95–5.60倍。在DNA水平,风干土细菌多样性与湿润土无显著差异,但在RNA水平,风干土明显高于湿润土。非度量多维尺度及共发生网络分析表明,水稻土干湿交替过程中,土壤细菌的群落结构发生显著改变(P<0.05);在DNA和RNA水平,水稻土在干湿交替过程中均检测到8个相同的优势菌门,占所有微生物90%以上,但不同门相对丰度变化显著(P<0.05)。在DNA和RNA水平,湿润-风干处理显著增加绿弯菌门(Chloroflexi)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度,显著降低变形菌门(Prot...

关 键 词:水稻土  干湿交替  细菌群落  16S  rRNA  高通量测序  实时荧光定量PCR
收稿时间:2021/6/15 0:00:00
修稿时间:2021/8/25 0:00:00

Convergent adaption of bacterial community in a paddy field experiencing repeated drying-wetting cycles
ZHOU Xiaoli,BAO Lijun,LIU Xu,XIONG Yi,CHU Haiyan,JIA Zhongjun.Convergent adaption of bacterial community in a paddy field experiencing repeated drying-wetting cycles[J].Acta Microbiologica Sinica,2022,62(3):1004-1019.
Authors:ZHOU Xiaoli  BAO Lijun  LIU Xu  XIONG Yi  CHU Haiyan  JIA Zhongjun
Institution:School of Marine and Biological Engineering, Yancheng Teachers University, Yancheng 224007, Jiangsu, China;State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, Jiangsu, China;School of Environment and Energy, Peking University Shenzhen Graduate School, Shenzhen 518055, Guangdong, China;State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, Jiangsu, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China
Abstract:
Keywords:paddy soil  drying-wetting cycle  bacterial community  16S rRNA  high-throughput sequencing  real-time fluorescence quantitative PCR
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