海绵Pachychalina sp.体内细菌多样性的研究

通过非分离培养分析方法，直接从海绵体内提取细菌总DNA。以样品总DNA为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA。用16S rDNA限制性酶切片段长度多态性（ARDRA）和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalina sp.体内的细菌多样性进行了研究。在细菌16S rDNA的ARDRA图谱中，大多数克隆的酶切带谱间存在差异；随机挑选22个克隆进行测序得到它们的16S rDNA部分序列，大部分序列属于γproteobacterium和αproteobacterium，但有少数克隆序列与RDP数据库中收录的16S rDNA序列间的相似性极小，不参与系统发育树的构建。研究结果表明海绵Pachychalina sp.体内细菌组成具有丰富的多样性。