基于比较转录组学分析NaCl胁迫影响德尔卑沙门氏菌的耐渗机制 |
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引用本文: | 翟立公,李港回,黄菊,蔡秋慧,魏照辉,何晓东,曹睿,王俊颖.基于比较转录组学分析NaCl胁迫影响德尔卑沙门氏菌的耐渗机制[J].微生物学报,2023,63(8):3219-3234. |
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作者姓名: | 翟立公 李港回 黄菊 蔡秋慧 魏照辉 何晓东 曹睿 王俊颖 |
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作者单位: | 安徽科技学院, 安徽 滁州 233100 |
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基金项目: | 安徽省自然科学基金(2008085MC89) |
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摘 要: | 【目的】研究高渗胁迫条件下德尔卑沙门氏菌(Salmonella enterica subsp. enterica Derby, S. Derby)的转录组调控机制,分析差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)表达水平,探究在高渗胁迫影响下德尔卑沙门氏菌耐渗反应的相关代谢通路。【方法】通过高渗胁迫诱导德尔卑沙门氏菌的耐渗性,提取菌株的总RNA,去除rRNA,构建cDNA文库。利用转录组测序技术及生物学信息技术分析相关DEGs,并通过实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR)进行验证。【结果】胁迫组德尔卑沙门氏菌通过转录组测序结果发现有3 950个DEGs,其中具有显著上调的基因21个,显著下调基因38个。涉及到细胞膜蛋白、氨基酸的代谢等相关基因上调,协助德尔卑沙门氏菌在高渗环境中存活。与此同时,胁迫组德尔卑沙门氏菌的糖转运系统(sugar transport system, PTS)、糖酵解过程以及抗氧化性相关基因表达显著下调,这是由于高渗环境菌体需要在体内储存大量糖类等物质,从而降低了糖原的消耗,进而导致细胞外膜的脂多糖合成受到抑制,降低了高渗胁迫下德尔卑沙门氏菌细胞膜表面的O抗原的合成。【结论】高渗环境诱导后显著提高了德尔卑沙门氏菌的耐渗性,其中Na+/H+逆向转运蛋以及谷氨酸的代谢通路发挥着重要的作用,为进一步了解以及更好地控制其在食品中的污染提供了理论依据。
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关 键 词: | 高渗胁迫 德尔卑沙门氏菌 差异表达基因(DEGs) 转录组分析 实时荧光定量PCR |
收稿时间: | 2022/12/5 0:00:00 |
修稿时间: | 2023/2/27 0:00:00 |
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