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紫菜外生细菌抑菌活性及其多聚酮合酶(PKS Ⅰ)基因筛选
引用本文:方文雅,杨锐,朱鹏,单媛媛,严小军.紫菜外生细菌抑菌活性及其多聚酮合酶(PKS Ⅰ)基因筛选[J].微生物学报,2009,49(2).
作者姓名:方文雅  杨锐  朱鹏  单媛媛  严小军
作者单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波,315211;宁波大学海洋生物工程重点实验室,宁波,315211
基金项目:国家自然科学基金,宁波市科技项目,教育部长江学者与创新团队项目 
摘    要:目的]基于紫菜外生细菌抑菌活性的研究,本文对具有广谱抑菌活性的菌株进行了多聚酮合酶(Polyketide synthase Ⅰ,PKS Ⅰ)基因的筛选,以期获得PKS Ⅰ阳性菌株及探讨紫菜藻际微生物区系细菌的拮抗机制与PKS Ⅰ途径的关系.方法]利用琼脂柱法筛选出具广谱抑菌活性的菌株31株,以其基因组DNA为模板,设计引物扩增酮基合成酶(Ketosynthase, KS)片段基因并将其克隆到pMD19-T Vector,筛选出PKS Ⅰ阳性菌,进行16S rDNA测序分析.结果]紫菜外生细菌表现出广谱抑菌性.从温州病烂紫菜外生菌中筛选出3株具强抑菌活性的PKS Ⅰ阳性菌,BLAST比对结果显示:菌株WPhG3、WPySw1和WPySw2扩增得到PKS Ⅰ的KS结构域核苷酸序列所对应的氨基酸序列与Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168(NP. 389602)、Bacillussubtilis (ABR19776)和Aspergillus carbonarius(AAZ99721)的PKS Ⅰ的KS结构域的同源性分别达到98%、99%和98%;16S rDNA系统发生学分析显示它们均与Bacillus的同源性最高.结论]紫菜藻际微生物群落组成复杂,通过多条途径调节藻际微生物区系的平衡.PKS Ⅰ途径可能是温州病烂紫菜外生菌Bacillus表现抑菌活性的一种方式.

关 键 词:紫菜外生细菌  多聚酮合酶(PKSⅠ)  抑菌活性

Antibacterial activity of Porphyra spp. epiphytic bacteria and polyketide synthase Ⅰgene screening
Wenya Fang,Rui Yang,Peng Zhu,Yuanyuan Shan,Xiaojun Yan.Antibacterial activity of Porphyra spp. epiphytic bacteria and polyketide synthase Ⅰgene screening[J].Acta Microbiologica Sinica,2009,49(2).
Authors:Wenya Fang  Rui Yang  Peng Zhu  Yuanyuan Shan  Xiaojun Yan
Abstract:
Keywords:16SRdna
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