| 山东地区犬冠状病毒的分子流行病学调查及其基因型多样性分析 |
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| 引用本文： | 张传美,李文凤,张路宾,刘佳卉,单虎,杨海燕.山东地区犬冠状病毒的分子流行病学调查及其基因型多样性分析[J].微生物学报,2022,62(12):4981-4991. |
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| 作者姓名： | 张传美 李文凤 张路宾 刘佳卉 单虎 杨海燕 |
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| 作者单位： | 青岛农业大学动物医学院, 山东 青岛 266109 |
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| 基金项目： | 在青高校服务青岛重点学科(兽医学)(025/1119002)；2021年山东省专业学位研究生教学案例库(SDYAL21174) |
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| 摘 要： | 【目的】了解分析山东地区健康犬及腹泻犬中犬冠状病毒(CCoV)的分子流行病学及其基因型。【方法】采集2017年以来山东省宠物市场、流浪犬中心、犬舍、各地宠物医院等的健康和腹泻犬只的肛拭子样品，采用PCR方法检测CCoV及其CCoV-Ⅰ和CCoV-Ⅱ(CCoV-Ⅱa和CCoV-Ⅱb)基因分型情况，并对扩增出的M、S全基因进行测序分析。【结果】199份样品中，共检出CCoV阳性样品79份，健康犬中的检出率为40.2%(33/82)，腹泻犬中的检出率为39.3%(46/117)。健康犬中CCoV-Ⅰ型与CCoV-Ⅱ型阳性检出率分别为78.8%(26/33)和51.5%(17/33)；腹泻犬中CCoV-Ⅰ型与CCoV-Ⅱ型阳性检出率分别为39.13%(18/46)和80.4%(37/46)。基因型阳性比率分析表明，健康犬中单独感染CCoV-I型的比率最高，为48.5%(16/33)；腹泻犬中单独感染CCoV-Ⅱa比率最高，为47.8%(22/46)。测序分析获得48株M基因序列，遗传进化分析表明，12株CCoV-Ⅰ型毒株中除1株外，其余均从健康犬中分离。36株CCoV-Ⅱ型毒株中除7株来自健康犬外，其余均为腹泻犬中获得。获得的3株S全基因均来自腹泻犬且均属于CCoV-Ⅱa亚型。【结论】山东地区犬群中CCoV检出率较高，说明CCoV广泛流行，健康犬和腹泻犬中均存在多重感染情况，健康犬中主要流行CCoV毒株为CCoV-Ⅰ型，腹泻犬中主要流行CCoV-Ⅱa型。
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| 关 键 词： | 犬冠状病毒 基因型 M基因 S基因 序列分析 |
| 收稿时间： | 2022/4/1 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/8/19 0:00:00 |
Prevalence and genotypic diversity of canine coronavirus in Shandong Province |
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| ZHANG Chuanmei,LI Wenfeng,ZHANG Lubin,LIU Jiahui,SHAN Hu,YANG Haiyan.Prevalence and genotypic diversity of canine coronavirus in Shandong Province[J].Acta Microbiologica Sinica,2022,62(12):4981-4991. |
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| Authors: | ZHANG Chuanmei LI Wenfeng ZHANG Lubin LIU Jiahui SHAN Hu YANG Haiyan |
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| Institution: | College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, Shandong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | canine coronavirus genotype M gene S gene sequence analysis |
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